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猪Retn基因单核苷酸多态性和相关性状分析
摘要
目的:探讨猪Retn基因3个外显子、2个内含子和部分5,端启动子是否存在单
核苷酸多态性,及其与脂肪沉积调控、肥胖的相关性。方法:选择六个品种纯种猪(蓝
塘猪、陆川猪、临高猪、大白猪、长白猪、杜洛克)和长.蓝F2代资源家系,采用
因变异与猪脂肪沉积的的相关性。结果表明:
l、六个品种纯种猪Retn基因外显子除在外显予.2上检测有多态外,其余2个外
显子片断均未发现多态。此突变仅在地方品种临高猪中发现2例(C577G),且并未造
成氨基酸改变。其它地方品种与瘦肉型品种Retn基因外显子是否存在上述突变尚需
进一步证实。
2、六个品种纯种猪中Retn基因启动子片断发现3种基因型。外来瘦肉型品种大
白、长白、杜洛克猪中没有TT’CT型,即所检测的瘦肉型品种猪群体中不存在T
等位基因。地方品种蓝塘猪、陆川猪、临高猪都有CC、TT、CT基因型,且突变型
基因频率与瘦肉率呈负相关,与脂肪沉积呈正相关.
3、从纯种猪Retn基因内含子.1中检测到6种基因型,地方品种除蓝塘猪中没有
检测到F等位基因外,其余品种6个基因型都有,其中蓝塘猪和陆川猪等位基因E
是优势基因,临高猪等位基因F是优势基因;外来品种EE野生型是优势基因型,G0
型仅在长白猪中检测到2例,大自、长白、杜洛克猪中未检测到FF基因塑。等位基
因G基因频率按蓝塘猪、陆川猪、临高猪、杜洛克、大白猪依次降低且主要存在于
地方品种中,脂肪沉积量也是依次降低,推测14个核苷酸插入的突变型GG与脂肪
沉积相关。由此可见内含子.1中的突变主要存在于地方品种,其中等位基因E、F、
G在地方品种中分别占45.8%、33.1%、21.1%,而在瘦肉型品种等位基因E、F、G
依次占95.5%、1.7%、2.8%,说明不同等位基因的基因频率与品种及选育目标有关。
4、纯种陆川猪和临高猪Retn基因内含子.2中存在6种基因型,M是优势等位基
因,蓝塘猪未检测到LL型,优势等位基因是N;长白猪中检测到l例NN型,未见
LL型,野生型MM是优势基因型,占88.8%;大白、杜洛克猪中未检测到LL和NN
基因型,优势等位基因是M。其中等位基因N基因频率按蓝塘猪、陆川猪、临高猪、
长白猪、大白猪依次降低且主要存在于地方品种中,推测突变基因型NN与瘦肉率低、
脂肪含量高有关。
5、F2代Retn基因启动子、内含子.1、内含子.2都检测到3种基因型,其余无多
态,较之纯种猪多态性没有发现等位基因F、L。其中启动子三种基因型分布比较均
衡,等位基因c是优势基因,内含子.1等位基因E是优势基因,内含子-2等位基因
M是优势基因。脂肪相关表型性状的测定结果表明,各片段基因型间胴体平均背膘
厚、板油重、皮脂率大体上突变基因型大于野生型个体,瘦肉率则相反,这与上述纯
种猪各基因型频率分析结果一致,显示Rem基因突变可能导致猪机体脂肪沉积量、
皮脂率升高,推测Rein基因的突变与脂肪沉积调控相关。
关键词:胰岛素抵抗素基因,单核苷酸多态性,单链构象多态性,猪
II
of Nucleotide ofRetnGene
StudySingle Polymorphism
AndItsAssociationWithTraitsin
Pigs
Abstract
thecorrelationbetweenthe of nuclcotide
Objective:Toexplore polymorphismSm#e
Resisfin the offat
regurafiondiposition.
polymorphisms(SNPs)ofgene(Rctn)and
formutationsinth
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