牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH的扩增及生物信息学分析.pdfVIP

生物技术通报 ·研究报告· BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年第 期 2012 1 牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白 OmpH 的 扩增与生物信息学分析 1 2 1 2 1 赵文娟 田亮 薄新文 马勋 康立超 1 2 （新疆农垦科学院 新疆兵团绵羊繁育生物技术重点实验室，石河子 832000 ；石河子大学动物科技学院，石河子 832003） 摘 要 ： 旨在扩增牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白OmpH 的编码基因，并预测 OmpH 蛋白二级结构和 B 细胞抗原表位，从而 探讨牦牛多杀性巴氏杆菌外膜蛋白 OmpH 在免疫保护中所起的作用。对牦牛多杀性巴氏杆菌的外膜蛋白 OmpH 基因进行 PCR 扩增 及序列测定。应用生物信息学相关软件和方法，对牦牛多杀性巴氏杆菌 OmpH 蛋白的二级结构和 B 细胞抗原表位进行预测。牦牛 多杀性巴氏杆菌 OmpH 基因全长 1 478 bp,ORF 包含 1 002 bp 编码 333 个氨基酸。二级结构以无规卷曲为主，有少量的 α- 螺旋和延 伸带 ；推测 OmpH 蛋白有 1 个细胞黏附位点、2 个糖基化位点。 关键词 ： 牦牛多杀性巴氏杆菌 外膜蛋白 H 二级结构 B 细胞抗原表位 功能预测 Amplification and Sequence Analysis of Pasteurella multocida Outer Membrane Protein OmpH from Yak 1 2 1 2 1 Zhao Wenjuan Tian Liang Bo Xinwen Ma Xun Kang Lichao 1 （The Breed and Biotechnology Key Laboratory of Sheep in Xinjiang Bingtuan ，Xinjiang Academy of Agricultural and Reclamation Science, Shihezi 832000; 2College of Animal Science and Technology, Shihezi University, Shihezi 832003 ） Abstract: The aims of this study was to amplify and sequence the OmpH gene of pasteurella multocida, and predict its secondary - structure and B cell epitopes, which provides a theoretical basis for the study of immune mechanism and Pasteurella m