菜豆ANK基因家族鉴定及ANK25的表达模式分析.pdfVIP

植物遗传资源学报２０１４，１５（６）：１３３４⁃１３４１ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｐｌａｎｔ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ ＤＯＩ：１０．１３４３０／ ｊ．ｃｎｋｉ．ｊｐｇｒ．２０１４．０６．０２３ 菜豆ＡＮＫ基因家族鉴定及ＡＮＫ２５ 的表达模式分析 １，２ ３ ２ ２ ２ 张　 婷 ，张双喜 ，裴丽丽 ，于太飞 ，陈　 明 ， ２ ２ ２ １ ２ 李连城 ，周永斌 ，马有志 ，徐　 强 ，徐兆师 １ ２ （ 安徽农业大学园艺学院，合肥２３００３６； 中国农业科学院作物科学研究所／ 国家农作物基因资源与基因改良重大科学 工程／ 农业部麦类生物学与遗传育种重点实验室，北京 １０００８１；宁夏农林科学院农作物研究所，永宁７５０１０５） 　 　 摘要：锚蛋白重复序列模体是生物体内最普遍的蛋白质序列模体之一，在多种细胞活动中主要介导蛋白质－蛋白质的相互 作用。 本研究利用菜豆基因组数据库，通过生物信息学手段对菜豆ＡＮＫ 家族成员及分子生物学特性进行了鉴定。 结果显示，菜 豆基因组中含有３０ 个ＡＮＫ 家族基因，分布于９条染色体上，其中第５条染色体上含有的ＡＮＫ基因最多，包含１３ 个基因。 蛋白 结构域分析发现，ＡＮＫ２５ 除了含有ＡＮＫ结构域外还含有ＲＩＮＧ结构域。 亚细胞定位结果显示，ＡＮＫ２５主要分布在细胞膜上。 表 达模式分析发现，ＡＮＫ２５对干旱、盐和ＡＢＡ胁迫有响应。 本研究为进一步研究菜豆ＡＮＫ的分类及功能提供了有利的依据。 　 　 关键词：ＡＮＫ重复序列；生物信息学；亚细胞定位；表达模式；菜豆 Ｇｅｎｏｍｅ⁃ｗｉｄｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＡＮＫ Ｇｅｎｅ Ｆａｍｉｌｙ ａｎｄ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｐａｔｔｅｒｎ ｏｆ ｔｈｅＡＮＫ２５ Ｇｅｎｅ ｉｎ Ｓｎａｐ Ｂｅａｎ １，２ ３ ２ ２ ＺＨＡＮＧＴｉｎｇ ，ＺＨＡＮＧ Ｓｈｕａｎｇ⁃ｘｉ ，ＰＥＩ Ｌｉ⁃ｌｉ ，ＹＵ Ｔａｉ⁃ｆｅｉ ， ２ ２ ２ ２ １ ２ ＣＨＥＮ Ｍｉｎｇ ，ＬＩ Ｌｉａｎ⁃ｃｈｅｎｇ ，ＺＨＯＵ Ｙｏｎｇ⁃ｂｉｎ ，ＭＡ Ｙｏｕ⁃ｚｈｉ ，ＸＵ Ｑｉａｎｇ ，ＸＵ Ｚｈａｏ⁃ｓｈｉ １ ２ （ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｈｏｒｔｉｃｕｌｔｕｒｅ，ＡｎＨｕｉＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，ＨｅＦｅｉ２３００３６；Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｃｒｏｐ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，ＣｈｉｎｅｓｅＡｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ（ＣＡＡＳ）／ ＮａｔｉｏｎａｌＫｅｙ Ｆａｃｉｌｉｔｙｆｏｒ Ｃｒｏｐ Ｇｅｎｅ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔ／ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔ ｏｆ Ｔｒｉｔｉｃｅａｅ Ｃｒｏｐｓ，Ｍｉｎｉｓｔｒｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ，Ｂｅｉｊｉｎｇ １０００８１； ３Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｃｒｏｐ