金鱼品系遗传多样性的分析及系统分类探讨.pdfVIP

上海水产大学硕士论文 金鱼品系遗传多样性分析及系统分类探讨 摘要 金鱼原产于我国，是著名的观赏鱼之一。从遗传物质DNA的角度来 分析金鱼的遗传多样性、品种间的遗传差异及亲缘关系对金鱼的种质 资源保护和遗传改良具有重要的意义。本研究通过基因组DNA的RAPD扩 增、线粒体DNA细胞色素b基因和核糖体内部间隔区ITS-1测序，对草金 鱼、红龙睛、鹤顶红、水泡眼、黑寿等金鱼品系以及鲫鱼的遗传结构 进行比较分析，从分子水平上探讨5种金鱼的遗传多样性、系统分类和 进化。 1金鱼RAPD遗传多样性分析和亲缘关系探讨 用经过筛选的14条引物对3个不同地区养殖金鱼(鹤项红)群体 进行RAPD扩增，共获得103条扩增条带，其中多态性条带数为27条， 占26．21％；单个引物扩增产生的条带数为4一ll条，扩增片段大小主 个金鱼群体内遗传多样性偏低，遗传相似度为0．9519-0．9785。金鱼3 个群体间遗传分化程度较低。UPGMA法和NJ法的聚类分析结果一致， TJ群体和Js群体优先聚类，再与Fz群体聚类。14个引物在草金鱼、 红龙睛、鹤顶红、水泡眼、黑寿等5个金鱼代表品种(每个品种30尾) T 上海水产大学硕士论文 共检测出123个位点，其中多态性位点29个。金鱼群体总的DNA多态 位点百分率为33．8％。5种金鱼群体间的遗传相似性指数均在 0．818—0．8759之间，存在一定的差异，群体间遗传多样性差异不明显。 群体间遗传相似性指数最小的为草金鱼和黑寿(O．8759)，亲缘关系最 远；鹤顶红与黑寿的遗传相似性指数最大(0．9182)，亲缘关系较近。 UPG姒法和NJ法的聚类分析显示，草金鱼和红龙睛，鹤顶红和黑寿有 较近的亲缘关系，这与传统金鱼品种形态学上的观点基本一致。 2金鱼线粒体DNA Cytb基因序列分析及与鲫鱼亲缘关系探讨 通过PCR扩增和扩增产物测序，获得草金鱼、红龙睛、鹤顶红、 水泡眼、黑寿以及鲫鱼线粒体DNA细胞色素b(Cytb)基因全序列，结 果显示金鱼Cytb基因全序列l141bp，起始密码子为ATG，终止密码子 为T，其中T、C、A、G4种碱基含量分别为29．2％，27．8％，28．5％， 鹤项红、水泡眼、黑寿Cytb基因全序列完全一致。说明细胞色素b基 因在金鱼种内是相当保守的，草金鱼、红龙睛、鹤顶红、水泡眼、黑 寿起源于同一祖先。比较草金鱼与鲫鱼序列，检测出24个核苷酸变异 位点，约占碱基总数的2．1％。鲫鱼和金鱼线粒体Cytb基因序列的同源 性达97．9％，说明还在同一种的水平上。 3金鱼核糖体转录间隔区(ITS-I)克隆和序列分析 通过PCR扩增和扩增产物测序，得到金鱼(水泡眼品系)转录间隔 其中A、T、G、C Ⅱ 上海水产大学硕士论文 较大的差异；根据金鱼与其他13种鱼的ITS-I序列同源性所建立的系统 进化树与这些鱼类的传统分类地位基本吻合。 关键词：金鱼，系统分类，RAPD，细胞色素b基因，ITS-I区，遗传多 样性 Ill[ 上海水产大学硕士论文 StudiesontheGenetic and diversity PhylogeneticTaxonomy ofGoldfishCarassiusauratus ABSTRACT Goldfish Carassiusauratusisoneofthefamousornamentfish．Itis to the and offive veryimportantstudy geneticdiversityrelationship