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细菌鉴定流程
细菌鉴定
细菌形态学鉴定 16S rDNA 鉴定 生理生化鉴定
细菌形态学鉴定
从-80??冰箱中取出菌株放4??复苏,轻柔混匀后用接种环接一环菌液在培养基平板上划线活化,根据菌株来源选择适宜的培养基。
放入培养箱倒置培养,实验室一般采用28??培养,特殊菌株依据该菌最适条件(时间、温度)培养24-48h。
3. 纯化:从活化培养基平板上挑取单菌落继续划板培养。
4. 观察记录菌落形态特征:大小(mm)、形状、干湿、透明度、颜色、边缘整齐还是,,,,,,,
细菌 大小(mm)形状 干湿 透明度颜色 边缘
注意事项:
接种划线应在酒精灯旁边操作
培养时应倒置培养,防止污染
二、革兰氏染色
涂片固定
将纯化后的菌株进行革兰氏染色,滴一滴生理盐水于载玻片上,无菌条件下用接种环挑取少量菌落均匀涂布水滴中,使其自然干燥,菌面向上,经火焰固定。
注意事项:菌液涂片时不可过于浓厚,干燥、固定。固定时通过火焰1~2次即可,不可过热,以载玻片不烫手为宜。
染色
一般包括初染、没染、脱色、复染等四个步骤,具体操作方法是:
加上结晶紫后,染色1分钟,水洗。
加上碘液染色1分钟,水洗。
加上95%酒精,摇动玻片,根据涂片厚度,脱色约20~60秒,水洗,吸去水分。
加上蕃红后,染色1分钟,水洗。
吸干或在空气中晾干后,油镜镜检。
结果观察:革兰氏阴性菌呈红色,革兰氏阳性菌呈紫色。以均匀分散开的细菌的革兰氏染色反应为准,过于密集的细菌,都常呈现假阳性。
注意事项:
① 标本涂片不能太厚,严格按操作要求进行。若涂片较厚,应延长脱色时间,直至不再出现紫色为止。
② 玻片通过火焰温度不能太高。
③ 碘液变透明,则不能使用。
④ 水洗时动作要轻,沿载玻片对角线方向用洗瓶冲洗,以免把菌体冲掉。
三、16S rDNA 鉴定
(16S rDNA只能鉴定到属,需进行生理生化、药敏实验等鉴定到种)
1. 细菌复苏、活化、纯化同细菌形态学鉴定
3. 挑取单菌落至少2-3个接到含有1ml灭菌纯水的1.5ml离心管中混匀。
4. 沸水浴10min,12000rmp离心2min,取1.5ul上清作为模板,上下游引物各0.5ul加到23ul体系中,每个样品做3个平行,进行PCR扩增。
注意事项:
① 使用离心机时一定要配平,防止损坏离心机。
② 实验前所用离心管、纯水、枪头要灭菌后使用。
(若结果不理想则用改良方法)
1.收集菌体,或直接从平板上刮取细菌(直径约1.5-2mm左右大小菌落的菌量),加入含20ul 0.1-0.5% Triton X-100的200ul PCR管中,充分重悬。
2.对于较难散开的细菌则可采用500ul体积(同样含0.1-0.5%Triton X-100),使用超声重悬(菌体相应增加),处理后取出20ul加入200ul PCR管中。
3. 将上述PCR管置于沸水中水浴处理5分钟,短暂离心(约30s)后,取1ul作为模板加入20ul(或25ul)体系中,进行PCR扩增。
0.1-0.5% Triton X-100的配置:
① 30%储备液的配置
Triton X-100 1.41ml
0.1mol/L PBS(pH=7.3) 3.64ml
充分混合后,置37℃~40℃水浴中2~3h,使其充分溶解混匀,备用。
② 用前取该储备液稀释至所需浓度,取1-5ul储备液加入300ul双蒸水中。
普通PCR体系:(23ul反应体系) 50管×PCR体系配制
ddH2O 918.5ul
10×buffer 125ul
dNTP 100ul
rTaq 6.5ul
配制体系所用的200μl PCR管、1.5ml离心管、纯水、1ml枪头、200μl枪头、10μl枪头均需灭菌,且在无菌操作台中操作。
配制体系前先将50个200μl的PCR管放在冰盒上预冷。
取一个无菌的1.5ml离心管,依次将药品加入管中,在漩涡混合器上混合5~10秒。
每23μl分装入200μl PCR管中,放-20??备用。
使用体系之前先验证体系是否好用。
例如:取实验室已知菌加16s上下游引物进行PCR反应,电泳后凝胶成像系统观察是否有已知条带。
注意事项:
(1)10×buffer、dNTP、rTaq用完尽快放回-20??保存。
(2)无菌操作
PCR程序:
94?? 5min
94?? 30s
35个循环 55 ?? 30s
72 ?? 1 min 30s
72 ?? 1
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