06生物信息的传递.ppt

11、真核细胞中的mRNA帽子结构是（ ） A. 7-甲基鸟嘌呤核苷三磷酸 B. 7-甲基尿嘧啶核苷三磷酸 C. 7-甲基腺嘌呤核苷三磷酸 D. 7-甲基胞嘧啶核苷三磷酸 12、下面哪一项是对三元转录复合物的正确描述（ ） （A）σ因子、核心酶和双链DNA在启动子形成的复合物 （B）全酶、模板DNA和新生RNA形成的复合物 （C）三个全酶在转录起始点形成的复合物 （D）σ因子、核心酶和促旋酶形成的复合物 Gene symbol rpoA Gene description RNA polymerase, alpha subunit Primary source EcoGene:EG10893 * * 碱基大多为A，两侧为若干个嘧啶核苷酸 ? 两侧为富含G·C的序列 * ? 框内任何一个碱基的替代突变都是强烈的下降突变（反向） TATA是绝大多数真核基因的正确表达所必需的（没有TATA框的基因表达过程可能存在着某种替代机制） CAAT框前两个 G 的作用十分重要,缺失导致转录效率急剧下降 （距转录起始点的距离，正反方向影响都不大） * * 转录方向离开72bp的起始序列优先转录（该序列中可能含有引起转录终止的序列） 增强子的详细作用机制还处于探索中 * 在H2B的启动子中有两个OTC元件，2个CAAT框，1个TATA框 * snRNA，与其他基因的启动子相似 * 不同长度的5SrRNA基因中缺失部分用非特异性的DNA序列代替 * ? 其中内部启动子起被 RNApolⅢ 识别的作用，转录起始点附近的序列控制转录起始的效率 转录起始点附近的序列控制转录起始的效率 * Consensus－－一致同意 多数的 * * 开放型启动子复合物形成后,使RNApol聚合酶定向，顺流向下行使其转录功能。 * * RNA转录的起始过程结束→核心酶移动进入延伸过程 * * * * * * * * * * DNase 法鉴定的片段一般为40bp，为了得到准确的结果，一般采用足迹法（footprinting） * * ① ② ③ UACUACA - AG UG U4 U5 U6 E1 E2 U1 U2 UACUACA - AG UG U6 E1 E2 U1、U4、U5 Ⅰ类内含子的自我剪接 Ⅱ类内含子的自我剪接 1）顺式剪接：通过剪切将一个RNA分子内部的全部内含子剪掉，使外显子顺序连在一起的方式。剪接位点由内含子末端的序列决定，所有内含子的序列都是以GU开始，以AG结束。脊椎动物内含子5`末端的共有序列为AGGUAAGU。在内含子3`末端的共有序列是在一段10个嘧啶（U/C）之后有一个任意碱基，然后是C，最后是不变的AG，在3`末端剪接位点上游20和50个核苷酸之间有一个位点叫分支点，其中一个A为保守序列。 GUAAGUA（Py）n NCAG 外显子 5` 分支点 3`外显子 第一步,上游外显子(exon 1)与内含子5`末端GU之间的磷酸二酯键断裂,由分支点中的A上2`-OH为攻击基团,与内含子的5`末端GU之间形成2`-5`磷酸二酯键,而此时A依然用正常的3`-5`磷酸二酯键联结在另外2个核苷酸上，因此，内含子部分形成套索状结构。 第二步，外显子1的3`-OH末端攻击内含子AG和外显子2之间的磷酸二酯键，使外显子1和2联结在一起，内含子以套索状结构释放。 GUAAGUA（Py）n NCAG 2）、反式剪接：当两个内含子序列之间形成互补结构时，易出现反式剪接，少见： 3）、可变剪接： 通过同一个基因转录本于不同部位剪接产生不同大小，不同氨基酸序列的蛋白，形成结构上不同的系列蛋白产物，如抗原决定簇，抗体IgG分子的重链和轻链的可变区在形成时由可变剪切形成针对不同抗原的结构。 剪切可能跨跃外显子将不相邻的外显子相联，因而具有选择性，产生组织特异性的或个体特异性的蛋白质。 可变剪接有四种主要方式： 1)利用不同的启动子； 2)利用不同的poly(A)位点； 3)保留某些内含子； 4)保留或去除某些外显子。 在不同细胞类型中会有不同的情况发生，这可能是由于细胞类型依赖因子在其激活或抑制结合位点附近的加工位点的活性所造成的。 1)利用不同的启动子； 2)利用不同的poly(A)位点 3)保留某些内含子 4)保留或去除某些外显子 7、?RNA的自我剪节与催化，指I类内含子和II类内含子。存在于rRNA 和细胞器RNA的剪切中。 真核中的核糖体RNA分子 与原核相似，也是靠初级转录本的裂解而形成的。Cech从四膜虫的一个6.4k