第二章核酸化学解说.ppt

第二章 核酸化学 戊糖 碱 基 嘧 啶(pyrimidine) ?在DNA和RNA中都有胞嘧啶（C），胸腺嘧啶只出现在DNA分子中，尿嘧啶则只出现于RNA分子中。 ? 核苷=核糖+碱基 胺式亚胺式互变异构 酮式烯醇式互变异构 几种稀有核苷酸 细胞内游离核苷酸及其衍生物 腺苷酸及其多磷酸化合物 ATP的性质 ATP 分子的最显著特点是含有两个高能磷酸键。ATP水解时, 可以释放出大量自由能。 ATP 是生物体内最重要的能量转换中间体。ATP 水解释放出来的能量用于推动生物体内各种需能的生化反应。 ATP 也是一种很好的磷酰化剂。磷酰化反应的底物可以是普通的有机分子，也可以是酶。磷酰化的底物分子具有较高的能量（活化分子），是许多生物化学反应的激活步骤。 2.环化磷酸化 3.辅酶  NAD、NADP、FAD、HSCoA end DNA双螺旋结构的特点 DNA分子由两条DNA单链组成。 DNA的双螺旋结构是分子中两条DNA单链之间基团相互识别和作用的结果。 双螺旋结构是DNA二级结构的最基本形式。 DNA双螺旋结构的要点 （1）DNA分子由两条多聚脱氧核糖核苷酸链(简称DNA单链)组成。两条链沿着同一根轴平行盘绕，形成右手双螺旋结构。螺旋中的两条链方向相反，即其中一条链的方向为5′端→3′端，而另一条链的方向为3′端→5′端。 （2）嘌呤和嘧啶碱基位于螺旋的内侧，磷酸和脱氧核糖基位于螺旋外侧。碱基环平面与螺旋轴垂直，糖基环平面与碱基环平面成90°角。 （3）螺旋横截面的直径约为2nm，每条链相邻两个碱基平面之间的距离为0.34 nm，每10个核苷酸形成一个螺旋，其螺矩（即螺旋旋转一圈的高度）为3.4 nm。 （4）维持两条DNA链相互结合的力是链间碱基对形成的氢键。碱基结合具有严格的配对规律:A与T结合，G与C结合，这种配对关系，称为碱基互补。A和T之间形成两个氢键，G与C之间形成三个氢键。 在DNA分子中，嘌呤碱基的总数与嘧啶碱基的总数相等。 DNA双螺旋的稳定性 DNA双螺旋结构在生理条件下很稳定。 维持这种稳定性的因素包括：两条DNA链之间形成的氢键，碱基堆积力。 双螺旋结构内部形成的疏水区，消除了介质中水分子对碱基之间氢键的影响； 介质中的阳离子（如Na+、K+和Mg2+）中和了磷酸基团的负电荷，降低了DNA链之间的排斥力等。 改变介质条件和环境温度，将影响双螺旋的稳定性。 DNA二级结构的不均一性 1、 反向重复序列（回文序列）DNA序列中，以某一中心区域为对称轴，其两侧的碱基对顺序正读和反读都相同，即对称轴一侧的片段旋转180°后，与另一侧片段对称重复 2、 富含A T的序列高等生物中，A+T与C+G的含量差不多相等，但在它们的染色体的某一区域，A T含量可能很高。在很多有重要调节功能（不是蛋白质编码区）的DNA区段都富含A T碱基对。富含A T对。这对于复制和转录的起始十分重要， DNA分子间的三链结构 2.环形DNA的拓扑学特性 以260bp组成的线形B-DNA为例， 螺旋数260/10.4=25。 ①连环数（L） DNA双螺旋中，一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数，以L表示。松驰环：L=25 解链环：L=23 超螺旋：L=23②缠绕数（T） DNA分子中的Watson-Crick螺旋数目，以T表示松驰环:T=25 解链环: T=23 超螺旋: T=25③超螺旋周数（扭曲数W）松驰环:W=0 解链环:W=0 超螺旋:W= -2L=T+W 环形DNA的拓扑学特性 ④比连环差（λ表示DNA的超螺旋程度 λ=（L—L0）/L0L0是指松驰环形DNA的L值 天然DNA的超螺旋密度一般为-0.03~-0.09，平均每100bp上有3-9个负超螺旋。负超螺旋DNA是由于两条链的缠绕不足引起，很易解链，易于参加DNA的复制、重组和转录等需要将两条链分开才能进行的反应。 DNA的存在形式 真核生物染色体DNA组装不同层次的结构 （三）DNA的功能 RNA的结构特点 RNA是单链分子，因此在RNA分子中，嘌呤的总数不一定等于嘧啶的总数。 RNA分子中，部分区域也能形成双螺旋结构，不能形成双螺旋的部分，则形成单链突环。这种结构称为“发夹型”结构。 在RNA的双螺旋结构中，碱基的配对情况不象DNA中严格。G 除了可以和C 配对外，也可以和U 配对。G-U 配对形成的氢键较弱。不同类型的RNA, 其二级结构有明显的差异。 tRNA中除了常见的碱基外，还存在一些稀有碱基，这类碱基大部分位于突环部分. 真核mRNA与原核mRNA的比较 （二）tRNA的结构与功能 * tRNA的一级结构特点 含 10~2