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第三章 基因和基因组结构 天津医科大学药学院 侯丕勇 内容 第一节 基因和基因组 第二节 病毒和原核生物的基因特点 第三节 真核基因特点和基因组结构 第四节 细胞器基因组 第五节 癌基因和药物基因组 第一节 基因和基因组 一、基因 1、 基因的概念 2、基因定义的演变 3、基因的编码链 4、基因的阅读框架 5、基因的其他重要发现 二、基因组 一、 基因 1、基因的概念 是DNA分子上具有特定遗传效应的一段的核苷酸序列。 1）遗传效应： a 可以产生蛋白质产物或RNA产物（包括rRNA和tRNA ）形成生理功能； b 或对其它基因及其形成的生理功能起调节效应。 2）核苷酸序列：主要指DNA，对于RNA病毒来说则指染色体RNA。 朊病毒？ 2、基因定义的演变（1） 第一步： 一个基因控制一个性状： 1909年，约翰逊首次提出了基因（gene）的名词，用来表示孟德尔在豌豆杂交试验中所证实的遗传因子（控制生物性状）。 1910年，美国遗传学家摩尔根通过果蝇杂文实验证明基因在染色体上呈线性排列，“基因是染色体上的遗传功能单位” 。 基因定义的演变（2） 第二步：“一个基因一种酶” 1902，尿黑酸症（alkaptonuria）：酪氨酸苯环断裂。 1941，比德尔（Beadle）和塔图姆 链孢霉（Neurospora）：营养缺陷型菌株。 单倍体，药用菌（洛氏等基金资金支持） 基因定义的演变（3） 第三步： “一个顺反子一条多肽链” 到1957年，本泽尔（Bnezer）进一步提出的论断。这比“一个基因一种酶”的假说更为准确。 1、多亚基蛋白（编码基因不连续或不在同一条链上；一个基因编码多个肽链）。 2、基因可以再分（重组子，突变子） 2、基因定义的演变（4） 第四步：确定核酸是基因的物质基础 肺炎链球菌 1967年发表了全套的遗传密码表 ，确定生物的遗传信息以核苷酸碱基（A，T，G，C）的不同排列贮存干DNA分子中形成基因。遗传信息的以“DNA→RNA→蛋白质” 这种中心法则的方式表达。 第五步：朊病毒？ 3、基因的编码链 一个基因的DNA双链中，只有一条链可以用做转录的模板。关于这两条链的称呼有点混乱。 以前的文献称模板链为编码或有意义链。非模板链为无意义链， 近年来则反过来称模板链为反意义链（因其碱基序列与mRNA互补）．而非模板链为有意义链（因其碱基序列与mRNA相同，遗传基因密码和密码子一般是指mRNA中的碱基序列，有时也指DNA中编码链的碱基序列） 。 4、基因的阅读框架 DNA——蛋白质（翻译过程的需要读码） 阅读mRNA是以密码子为单位，连续阅读。即每个核苷酸三联体密码子之间没有空格。这样任何核苷酸序列都可能以三种方式分成不同的密码子，也就是说有三种读框。对于DNA两条链是六种。 开放阅读框 一个基因组由两部分组成的： 1、实验证明确有蛋白质产物的真实基因 2、根据起始密码和终止密码序列所确定的潜在基因。 生物学家们把这两类基因都称为“开放阅读框”(open reading frame，ORF)——读通的基因组。 ORF识别 类似于波谱解析。 ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或密码子，符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。 ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。 5、基因的其他重要发现 1．重叠基因 2．断裂基因 3．移动基因 4．多个基因编码一条多肽链 5．隐蔽基因 6．不编码蛋白质的基因 1．重叠基因 2．断裂基因 3．移动基因 玉米的染色体中发现了可以改变自身位置的基因，称之为“解离因子”。当它移动到新的位置以后，可以引起染色体断裂，使玉米籽粒出现色斑。 细菌转座子。转座子除了含有与改变自身位置有关的基因以外，还携带与插入功能无关的基因，如耐药基因、毒素基因和代谢基因等。 转座子 4．多个基因编码一条多肽链 有些病毒可以由一段DNA序列转录出一条mRNA分子，然后翻译出一条多肽链，最后这条多肽链被切割成多个有生物功能的肽链。 这种多个基因编码一条多肽链的现象，不符合“一个基因决定一条多肽链”的普遍原则，使基因的定义更加复杂化。 5．不编码蛋白质的基因 一类是核糖体RNA简称rRNA，它是核糖体的组成部分。 另一类是转运RNA简称tRNA其功能是把氨基酸搬运到核糖体会成多肽链的位点上。 二、基因组： 生物体中，一套完整的遗传物质的总和称为基因组（genome）。 比如人类基因组包含22条常染色体和X、Y两条性染色体上的全部遗传物质以及胞浆线粒体上的遗传物质。 几种生物基因组的比较 第二节 病毒、原核生物基因