六核酸序列的一般分析重点.pptVIP

序列格式转化 各种软件为了自己的需要，通常对序列格式有一定的要求，给我们的使用带来了一定的困难。格式转换软件可以将不同格式数据转换以方便使用。很多综合性软件可以进行序列格式转换，如DNAstar，seqverter等。 常见序列格式： （1）FASTA格式： 又称Pearson格式。是比较简单而使用最多的序列格式。序列以“”号开头，其后是单行的关于序列的描述信息，最后是序列。 例子： 10KD_VIGUN P18646 vigna unguiculata 10 kda protein precursor MEKKSIAGLCFLFLVLFVAQEVVVQSEAKTCENLVDTYRGPCFTTGSCDDHCKNKEHLLS  （2）plain text格式 是一个形式最简单的格式，没有任何的注释，每行60个字母，使用标准核甘酸符号或标准的氨基酸的单字母符号。例如： MEKKSIAGLCFLFLVLFVAQEVVVQSEAKTCENLVDTYRGPCFTTGSCDDHCKNKEHLLS 最新下载 /download.htm *下载后直接安装即可 序列翻译、ORF查找 对于一条新的核酸序列，除了对数据库进行类似性检索和同源性比较外，还有许多其他分析内容。例如：计算DNA的碱基组成、检索