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16 DNA重组与基因工程
第十六章 DNA重组与基因工程 第一节 DNA的重组 第二节 基因工程 第三节 DNA重组技术与医学 第一节 DNA的重组 同源重组 细菌的基因转移与重组 接合作用、转化作用、转导作用 特异位点重组 转座重组 一、同源重组:发生在同源序列间的重组,是最基本的DNA重组方式,通过链的断裂和再连接,在两个DNA分子同源序列间进行单链或双链片段的交换。 以E.coli的同源重组为例,了解同源重组机制的Holliday模型: 两个同源染色体DNA排列整齐; 一个DNA的一条链断裂、并与另一个DNA对应的链连接,形成Holliday中间体; 通过分支移动产生异源双链DNA; Holliday中间体切开并修复,形成两个双链重组体DNA。 拼接重组体 切开的链并非原来断裂的链,重组体异源双链区的两侧来自不同亲本DNA。 片段重组体 切开的链与原来断裂的是同一条链,重组体含有一段异源双链区,其两侧来自同一亲本DNA。 二、细菌的基因转移与重组 1、接合作用:细菌通过菌毛相互接触时,质粒DNA从一个细菌转移至另一细菌的现象。 可接合质粒如 F 因子(F factor) 2、转化作用:通过自动获取或人为供给外源DNA,使细胞或培养的受体细胞获得新的遗传表型。 例:溶菌时,裂解的DNA片段被另一细菌摄取。 3、转导作用:当病毒从被感染的(供体)细胞释放出来、再次感染另一(受体)细胞时,发生在供体细胞与受体细胞之间的DNA转移及基因重组。 例: λ噬菌体 溶菌生长途径 溶源生长途径 三、特异位点重组:由整合酶催化,在两个DNA序列的特异位点间发生的整合。 1、λ噬菌体DNA的整合 λ噬菌体的整合酶识别 噬菌体和宿主染色体 的特异靶位点发生选 择性整合; 反转录病毒整合酶可特 异地识别、整合反转 录病毒cDNA的长末端 重复序列(LTR)。 四、转座重组:由插入序列或转座子介导的基因移位或重排 1、插入序列(IS) 典型的插入序列组成: 二个分离的反向重复(IR)序列 一个转座酶(transposase)编码基因 特有的正向重复序列 2、复合转座子 转座子组成: 反向重复序列 转座酶编码基因 抗生素抗性等有用的基因 3、转座方式: 复制型转座(duplicative transposition) 非复制型转座(conservative transposition) 第二节 基因工程 克隆(clone):来自同一祖先的相同副本或拷贝的集合。 基因克隆:应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质与载体DNA连接,继而转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增提取获得大量同一DNA分子。 基因工程:也叫重组DNA技术,是人类根据需要选择目的基因(DNA片段),在体外与载体重组,再转移到另一细胞或生物体内,以达到改良性状和治疗人类疾病的目的。 一、基因工程相关的酶和载体 1、限制性核酸内切酶:简称限制酶,是一类能够识别双链DNA分子中的某种特定核苷酸序列,并由此切割DNA双链结构的核酸内切酶。 限制性内切酶的分类 根据酶的功能、大小和反应条件,及切割DNA的特点,可以将限制性内切酶分为三类:Ⅰ型酶、Ⅱ型酶、 Ⅲ型酶 限制酶的命名: 限制酶产生的末端: 限制酶识别双链DNA分子中4~8对碱基的特定序列(呈旋转对称型回文结构),大部分酶的切割位点在识别序列内部或两侧,产生粘性末端或平头末端。 同裂酶:指来源不同,但识别序列和产生末端相同的核酸内切酶。 同尾酶:指来源不同、识别序列不同但产生相同的粘性末端的核酸内切酶。 2、载体:能够通过基因重组技术携带外源DNA片段到达受体细胞,完成克隆或表达的DNA运载工具。 基本条件: 复制子:与特定受体细胞相适应的复制位点或整合位点,使携带的外源DNA一同扩增; 多克隆位点(MCS):具有多种限制酶的单一识别切割位点,有利于外源基因插入该区域; 筛选标记:抗药基因、酶基因、营养缺陷体及噬菌斑形成能力等,便于筛选出阳性重组体; 较小分子量和较高拷贝数:便于分子操作和质粒扩增; 生物安全性好:要求载体不能随便转移,仅限于在某些实验室内特殊菌种内才可复制。 分类:按来源分为质粒载体,噬菌体载体,柯斯质粒载体,真核细胞载体等。 质粒:细菌染色体外的小型环状双链DNA分子。 噬菌体:一类非细胞微生物,能高效率、特异性地侵染宿主细胞,然后自主复制繁殖(溶菌途径),或整合入宿主基因组中(溶源途径),在一定的条件下两种状态还会相互转化。 λ噬菌体DNA改造载体 λgt系列(插入型,适用cDNA克隆) EMBL系列(置换型,适用基因组克隆) M13噬菌体DNA改造载体(含lacZ基因) M13 mp系列 柯
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