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第十三章 RNA的生物合成 第一节 RNA转录的反应体系 第二节 RNA转录过程 第三节 转录后加工 第四节 核酶 第五节 RNA的复制 中心法则 the central dogma 转录（transcription）：生物体以DNA为模板合成RNA mRNA，tRNA，rRNA等 的过程 。 第一节 RNA转录的反应体系 一、RNA转录的特征 不对称性，共线性 1、不对称性：在RNA的合成中，DNA双链中某一区段仅有一条链可作为转录的模板。 模板链（反义链）：根据碱基互补原则指导mRNA合成的DNA链 编码链（有义链）：与mRNA序列相同的那条DNA链 在一个多基因的DNA双链分子中，模板链并非都在同一DNA单链上。文献上刊出的DNA单链，一般均指编码链。 RNA合成方向（转录方向）：5 3 2、共线性 DNA模板与mRNA分子及多肽链之间存在共线性关系 二、RNA转录的反应体系 1、底物：NTP ATP、GTP、CTP、UTP 2、模板：DNA 3、一些蛋白质因子 4、RNA聚合酶（RNA-pol，DNA-dependent RNA polymerase, DDRP）：主要以双链DNA为模板，以4种核苷三磷酸作为前体，合成RNA，它不需要任何引物。 原核生物RNA聚合酶：在细菌中，一种RNA聚合酶几乎负责所有mRNA、rRNA和tRNA的合成。 全酶：在起始阶段发挥作用。 核心酶：主要在转录延长阶段起作用，但不能在特定的起始点上开始转录。 真核生物RNA聚合酶：一般有8～14个亚基所组成，目前尚不能完成RNA聚合酶的体外重建，无法确定哪些亚基是活性所必需的。 第二节 RNA转录过程 一、原核生物的转录过程 1、转录起始 转录起始需解决两个问题： RNA聚合酶必须准确地结合在转录模板的起始区域。 DNA双链解开，以其中的一条链作为模板，合成第一个磷酸二酯键。 模板识别：RNA聚合酶全酶与DNA结合，σ因子识别启动子。 启动子：能被RNA聚合酶识别、结合并启动基因转录的一段DNA序列。 转录起始位点：DNA链上与新生RNA链第一个核苷酸 常为嘌呤 相对应的碱基，记为+1，上游记为-，下游记为+。 -10区（Pribnow盒）：TATAAT，位于-10bp处，RNA聚合酶的结合位点（富含AT，利于双链打开），使转录精确起始 -35区（Sexfama盒）：TTGACA，位于-35bp处，RNA聚合酶的识别位点，决定转录起始的频率。 -10区与-35区的距离：16～19bp，小于15bp或大于20bp都会降低启动子的活性。 起始转录：RNA聚合酶结合到启动子上后，使启动子附近的DNA解链，以其中一条链为模板，按碱基配对原则，结合核苷酸，在核苷酸之间形成磷酸二酯键。 2、转录延伸：新生RNA链合成到约9个核苷酸时，RNA聚合酶释放σ因子，核心酶沿着模板DNA移动并使新生RNA链不断伸长。 电镜下原核生物转录过程中 的羽毛状现象 3、转录终止：当RNA链延伸到终止位点时，RNA停止合成，转录复合物解离。 根据转录终止是否需要辅助因子，可将终止子分为两类： 不依赖于ρ因子的终止：强终止子 依赖于ρ因子的终止：弱终止子 不依赖于ρ因子的终止： 终止位点上游有一个富含GC的反向重复序列，其转录生成的mRNA容易形成发夹结构。 终止位点前面有一段4～8个A组成的序列，其转录生成的mRNA 3′末端有相应的一连串U序列。 依赖于ρ因子的终止： ?因子：六聚体蛋白、具有ATP酶和解螺旋酶活性，促使新生RNA链从转录复合物中解离出来，从而终止转录。 “穷追”模型 二、真核生物的转录过程 1、转录起始： 真核生物启动子有三种，1）RNA聚合酶Ⅱ启动子： 转录起始位点 TATA区 TATA box或Hogness区 ：TATAAA，位于-25～-35，核心启动元件，使转录精确起始。 CAAT区 CAAT box ：CCAAT，位于-70～-80，上游启动子元件，控制转录起始频率。 GC区 GC box ：GGGCGG，位于-80～-110，上游启动子元件，控制转录起始频率。 2）RNA聚合酶I启动子：由转录起始位点附近的两部分序列构成。 核心启动子（core promoter）：位于-45～+20，单独存在时就足以起始转录。 上游调控元件 ：位于-170～-107，能有效地增强转录效率。 3）RNA聚合酶III启动子: 5S rRNA和tRNA基因的启动子位于转录起始点的下游，称为内部启动子（internal promoter）。 snRNA基因的启动子位于转录起始点的上游，和其他基因的启动子比较相似。 增强子：增强同它连锁的基因转录起始的DNA序列，可以位于转录起始位点的任何方向和任何位置。 真核细胞转录起始与原核细胞有所不同