第三章蛋白质化学研讨.ppt

第三章 蛋白质化学;蛋白质的定义：;思考： 1、蛋白质的元素组成特点 ： 2、组成蛋白质的基本单位 ： ;第一节 蛋白质概论;特点： 1、均含C、H、O、N 四种元素； 2、各种蛋白质的平均含氮量为16%。 ; ; 生物样品中蛋白质含量=样品中含氮量×6.25 ;二、蛋白质的分类;2、按分子形状分类;第二节 蛋白质的基本结构单位;一、氨基酸的结构与分类;组成蛋白质的氨基酸的共同结构特点 ：;（2）L-型氨基酸：;甘氨酸结构式：;2、氨基酸的分类;20种标准氨基酸分类;烃基;羟基;蛋氨酸;氨基;(酸性氨基酸);20种标准氨基酸分类;思考：;二、氨基酸的主要理化性质：;1、紫外吸收特征：;;2、两性解离与等电点：;两性电解质：;氨基酸的电离式：;氨基酸等电点的测定;3、氨基酸的化学性质;（1）茚三酮反应：;蓝紫色;（2）氨基酸与2，4-二硝基氟苯（DNFB)的反应;应用：鉴定多肽或蛋白质的N-末端氨基酸;DNFB法分析N-端氨基酸残基;（3）氨基酸与苯异硫氰酸酯（PITC）的反应; ;Edman降解法测定氨基酸序列;（4）α-羧基的反应;即时回顾：;4、组成蛋白质的氨基酸的共同结构特点 ：;第三节 肽;一、肽与肽键; 1、肽是氨基酸的链状聚合物;谷氨酸残基;多肽链的主链和侧链：;多肽链的两端：;三、生物体内重要的肽;区别：;生物活性肽;生物活性肽;思考： 1、蛋白质的分子结构包括哪些层次？ 2、蛋白质一级结构研究的内容包括哪些方面？ 3、测定蛋白质一级结构的基本步骤： 4、何谓超二级结构？何谓结构域？ 5、维系蛋白质各级结构的化学键是什么？ ;第四节 蛋白质的分子结构;蛋白质的分子结构;一、蛋白质的一级结构;蛋白质一级结构研究的内容;牛胰岛素的一级结构：;;研究蛋白质的一级结构的主要意义：;细胞色素c的一级结构与生物进化的关系;1.一级结构与空间结构的关系;牛胰核糖核酸酶复性实验;;2、蛋白质一级结构的测定;蛋白质一级结构测定的基本步骤;蛋白质一级结构测定的基本步骤;蛋白质的氨基酸组成分析;（3）分析蛋白质多肽链的N-端和C-端氨基酸。;（4）将每条多肽链用两种不同方法进行部分水解。;胰蛋白酶（trypsin)的裂解作用;BrCN的裂解作用;（5）分离纯化单一肽段。;Edman降解法测定氨基酸序列;（7）氨基酸完整顺序的拼接; ;思考题：;;(8)二硫键位置的确定;二、蛋白质的空间结构;2、二级结构;肽单元与肽平面;83;二级结构的基本形式：;（1）α-螺旋：;1;氢键的形成常见于连接在一电负性很强的原子（如：N、O）上的氢原子，与另一电负性很强的原子（如：N、O）之间形成的化学键。 ;α-螺旋的结构特征：;（2）β-折叠：;β-折叠包括顺向平行和反向平行两种类型：;?-折叠的结构特征：;（3）β-转角：;β-转角的结构特征：;（4）无规则卷曲：;维系蛋白质二级结构的主要化学键：;3、超二级结构和结构域;（1）超二级结构;几种类型的超二级结构：;锌指结构 (螺旋-折叠-折叠模序);特点：;（2）结构域;特点：;4、蛋白质的三级结构;磷酸丙糖异构酶和丙酮酸激酶的三级结构;(2)特点;（3）维系蛋白质三级结构的主要化学键：; 疏水键： 非极性物质在含水的极性环境中存在时，会产生一种相互聚集的力，这种力称为疏水键或疏水作用。 蛋白质分子中的许多氨基酸残基侧链也是非极性的，这些非极性的基团在水中也可相互聚集，形成疏水键，如Leu，Ile，Val，Phe，Ala等的侧链基团。;离子键（盐键）： 离子键(salt bond)是由带正电荷基团与带负电荷基团之间相互吸引而形成的化学键。 在近中性环境中，蛋白质分子中的酸性氨基酸残基侧链电离后带负电荷，而碱性氨基酸残基侧链电离后带正电荷，二者之间可形成离子键。;蛋白质分子中离子键的形成;范德华氏（van der Waals)引力： 原子之间存在的相互作用力。;（4）蛋白质三级结构的生物学意义：;5、蛋白质的四级结构;血红蛋白的四级结构：;（3）血红蛋白的四级结构;（4）维系蛋白质四级结构的主要化学键：;判断：; 第五节 蛋白质结构与功能的关系 ;一、蛋白质一级结构与功能的关系;;三、蛋白质空间结构与功能的关系;血红蛋白的氧饱和曲线;例2 朊病毒病;朊病毒：;朊病毒蛋白（PrP）：;;思考： 1、何谓蛋白质的等电点？当溶液p