- 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
- 5、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
蛋白质
鉴定流程;质谱数据的预处理;1 原始质谱数据的预处理;1 原始质谱数据的预处理;质谱数据的预处理;2 谱峰中心化后的质谱数据的预处理;2 谱峰中心化后的质谱数据的预处理;1) 信号峰的识别;1) 质谱噪声基线的识别;(1)固定基线算法;(1)固定基线算法;(2)固定峰数法;(3)窗口基线法(a);;(3)窗口基线法(b);(3)窗口基线法(b);(4)窗口基线法和固定峰数法的结合;;2 谱峰中心化后的质谱数据的预处理; 有效峰选取;;;;去同位的效果;;通过质谱去鉴定多肽序列;;;通过质谱去鉴定多肽序列;质谱分析蛋白的方法;;PMF鉴定蛋白质;;胰酶消化;An example;蛋白质酶解;;VGAHAGEYGAEALER;;PMF VS blast;常用的质量纹算法;Mascot简介;;打分算法---分数计算;打分算法---分数计算;;;;;;;;;;;;;;;PMF中的问题;解决方案;长蛋白和短蛋白;多个蛋白的情况;多肽质量纹:小结;;串联质谱;;;数据库搜索方法原理;理论谱的构造;理论谱构造(SEQUEST);理论质谱图和试验质谱图;数据库搜索鉴定肽; GPM(X!tandem) SEQUEST Mascot
类型 免费开源软件 商业软件 商业软件
数据输入 DTA,PKL,MGF RAW,DTA MGF,DTA
mzXML,mzDATA
速度 快 较慢 较慢
并行运算 支持(PVM,MPI) 支持(PVM) 支持(MPI)
;
优点:
运算速度快
免费,并行集群计算成本低
开源可自行修改代码
缺点:
应用范围尚不广泛
后期统计软件接口尚未成熟
;工作流程:
将 *.raw 文件转变为 *.mzXML 文件
2. 编辑参数
3. 运行 GPM中的X!Tandom
4. 查看结果
5. 使用自己的数据库;;;;;小结
文档评论(0)