第一节蛋白质的化学修饰01要点分析.pptVIP

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* 第 一节 蛋白质的 化学修饰 化学修饰的原理 化学修饰的方法学 蛋白质侧链的修饰 蛋白质肽链的交联 亲和标记 蛋白质化学修饰的应用 内 容 提 要 (第八讲) 化学修饰:凡通过化学基团的引入或除去,而使蛋白质 共价结构发生改变的现象。 选择性化学修饰:肽链侧链基团被化学试剂专一性地修饰。 第一节 化学修饰的原理 影响因素 蛋白质功能 基的反应性 修饰剂的 反应性 一、影响蛋白质功能基反应性的各因素 因为大多数蛋白质分子是(亲水的表面,疏水的核),所以pk值和影响pk值的因素应特别关注。 (一)微区的极性 微区的极性是决定基团解 离状态的关键因素之一。 醋酸的 pk值 在水中为4.76 在80%乙醇中为6.87 在100%乙醇中为10.32 微区的极性与介质的介电常数有关。 (二)氢键效应 天然蛋白质或它的离子通过氢键来维持其稳定性,也是使pk值发生改变的一个因素. (三)静电效应 研究表明,不同蛋白质中的组氨酸残基的pk值是不同的,原因是由于带电基团相互影响所致。 局部极性 的变化 对色、甲硫、胱氨酸反应性影响最小 对酪、半胱氨酸、羧基反应性影响最大 对氨基和组氨酸反应性影响较大 例如:2-氟酚的pk值比2-溴酚的pk值高0.7pH单位,原因是氟与酚形成氢键的能力比溴强。 水杨酸 碳酸酐酶: 5.91; 6.04; 7.00; 7.23 葡萄球菌核酸酶: 5.37; 5.71; 5.74; 6.50 (四)位阻效应 如果烷基在空间上紧靠功能基,修饰剂不易与功能基反应,出现位阻效应。 影响蛋白质中可电离氨基酸侧链的pk值的因素,也是影响侧链基团反应性的重要因素。蛋白质中个别功能基所处的微区不同,反应性也不同,个别功能基的反应性可通过竞争标记法来测定。 二、蛋白质功能基的超反应性 例如:碳酸酐酶和葡萄球菌核酸酶各有4个组氨酸残基,其pk值是: 影响功能基pk值 基团之间的功能障碍 影响功能基反 应性的因素 多数蛋白质的功能基与简单氨基酸中的同样基团相比,反应性要差。但是,每个蛋白质分子中至少有一个基团对一定的试剂显示出超反应性。 影响超反应性的因素: 1.改变蛋白质功能基的pk值; 2.蛋白质功能基具有较大的亲核性; 3.通过静电相互作用吸引试剂,并使其有适当取向; 4.试剂与靠近修饰部位的蛋白质区域之间的立体化学适应性; 5.试剂的结合。 超反应性可由上述一个或几个因素的综合作用而产生。 超反应性:蛋白质的某个侧链基团与个别试剂能发生非常 迅速的反应。 三、修饰剂反应性的决定因素 蛋白质的构象和表面特性对氨基酸侧链的反应性有影响,同样,它们也可能对接近功能基的修饰剂产生有利或不利的影响。 木瓜蛋白酶中的19个酪氨酸残基, 只有一个能与修饰剂反应,修饰 后酶活性并不改变,说明什麽? (一)选择吸附 化学修饰前,修饰剂根据各自的特点,选择性地吸附在低或高极性区,根据对速度的饱和效应,可检测出蛋白质-修饰剂复合物的形成。 (二)静电相互作用 带电的修饰剂能被选择性地吸引到蛋白质表面带相反电荷的部位。 静电排斥力能抑制修饰作用。 (三)位阻因素 蛋白质表面的位阻因素,或者底物、辅助因子、抑制剂所产生的位阻因素都可能阻止修饰剂与功能基的正常反应。 D-氨基酸氧化酶的巯基与N-烷基马来酰亚胺的反应,巯基的辛基化速度比乙基化速度快15倍。 核糖核酸酶第12 号组氨酸烷化 α-溴代丁酸反应很快; α-溴代戊酸反应很慢; α-溴代己酸不能反应。 (四)催化因素 修饰部位附近的其它功能基,如果起一般的酸碱催化作用,也能影响修饰反应。不同的修饰剂,反应速度和反应部位有明显差异。 (五)局部环境的极性 溶剂效应是复杂的。有些有机反应的速度与溶剂的极性有关,有些反应则与极性无关。 反 应 类 型 降低极性对速度的影响 ⑴RSR+ICH2CONH2→[R2S+CH2CONH2]I- 溶剂极性对反应速度的影响 适当降低或大大降低 没有影响 没有影响 适当增加或大大增加 ⑵RSR+H2O2→R2SO+H2O ⑶RS-+ICH2CONH2→RSCH2CONH2+I- ⑷RNH3++OCN- →RNHCONH2 胰凝乳蛋白酶活性中 心丝氨酸的乙酰化 硝基苯乙酸盐反应强 苯乙酸盐反应弱 疏水环境 阻止产物中电荷分离的反应 加速电荷中和的反应 第二节 化学修饰的方法学 一、修饰反应专一性的控制 (一)试剂的选择 选择试剂在很大程度上要依据修饰目的。 反应类型⑴ 反应类型⑷ 对于没有电荷分离和电荷只是从一个离子转移到另一个离子的反应,则介质的极性不重要。 对氨基 的修饰 修饰所有氨基,而不修饰其它基团; 仅修饰α-氨基; 修饰暴露的或反应性高的氨基,以及 修饰有催化活性的氨基等。 修饰的部位和程度一般可用选择适当的试剂和反应条件 来控制。 选择蛋白质修 饰剂要考虑:

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