分子模拟第二章要点.pptVIP

Chapter 2. Single Point Energy Calculations第二章 单点能计算 2.1 Single point energy (单点能) 单点（能）计算：指对给定几何构型的分子的能量以及性质进行计算 。在势能曲面上相对应的只是一个点，所以简称单点（能）计算。 * 计算分子的基本信息 * 可以作为分子构型优化前对分子的检查 * 在由较低等级计算得到的优化结果上进行高 精度的计算 * 在计算条件下,体系只能进行单点计算 单点能计算可以用于： 2.2 Gaussian03计算关键词设置 * 设置计算的理论等级和计算类型 　# HF/3-21G Pop=Reg SCF=Tight * 计算的名称: 对所进行计算任务的描述 * 电荷,自旋多重度 * 分子几何构型 2.3 输入文件格式 # RHF/6-31G(d) Pop=Full Test 采用的理论等级和计算种类 Formaldehyde Single Point 计算的名称 0 1 电荷　自旋多重度 C 　 0.0 　　 0.0 　　0.0 几何坐标 O 　 0.0 　 　 1.22 　　 0.0 　　 H 　 0.94 　　-0.54 　　0.0 H 　 -0.94 　　-0.54 　　 0.0 标准几何坐标 2.4 输出文件中的信息 分子中所有核电荷的中心放在坐标原点 RHF计算的能量： SCF Done: E(RHF)= -113.863697598 A. U. after 6 cycles MP2计算的能量： E2=-0.3029540001D+00 (MP2的修正能量) EUMP2=-0.11416665769315D+03 =-114.16665769315 A. U. 原子单位au.: 1 hartree=627.5095 kcal/mol =27.21 eV 分子轨道和轨道能级 Pop=Full 第一行：分子轨道的编号，按能量从低到高的顺序依次排列； 第二行：轨道的对称性和电子占据情况，O表示占据,V表示空轨道； 第三行：各个轨道的轨道能，au.单位； 第四行以后：每列分别代表每个分子轨道中每个原子轨道的组合系数。 HOMO和LUMO轨道 Charge Distribution (电荷分布) Dipole and Higher Multipole Moments (偶极矩和四极矩) CPU时间 Job cpu time: x days x hours x minuites x seconds 2.5 核磁计算 关键词： # RHF/6-31G(d) NMR Test 计算结果： （以甲烷为例） GIAO Magnetic shielding tensor (ppm) 1 C Isotropic = 199.0522 Anisotropy = 0.0000 注意：实验上的核磁数据一般是相对TMS的数值。在同样计算级别下计算得TMS的屏蔽张量： 1 C Isotropic = 195.1196 Anisotropy = 17.5214 甲烷的NMR化学位移：195.1196-199.0522＝-3.9 ppm Expt. –7.0 ppm 2.6 课堂练习 Example 2.1: Formaldehyde(甲醛) Single Point Energy Example 2.2: Methane(甲烷) NMR Shielding Constants Exercise 2.1: Propene(丙烯) Single Point Energy Exercise 2.2: 1,2-Dichloro-1,2-Difluoroethane Conformer Energies 1,2-二氯-1,2-二氟乙烷分子不同构象的能量计算