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铁吸收调节蛋白的研究现状
摘要:铁吸收调节蛋白(ferric uptake regulator,Fur)是多种微生物茵体内调控铁的一种蛋白质,它编码一个铁感应器以及转录调控因子,可以根据细胞内Fe2+的浓度,氧化应激以及毒性来调控铁载体合成相关基因的表达。研究发现Fur不仅调节与铁相关的物质代谢,也与其他的物质代谢有着紧密的联系。综合国内外研究进展介绍了Fur的结构与功能,阐述了Fur在生物冶金、农业、医药等方面的研究进展,并对其应用前景以及研究趋势进行了展望。
关键词:铁吸收调节蛋白;铁代谢;结构与功能;生物冶金;应用
中图分类号:Q513
文献标识码:A
文章编号:1007-7847(2014)04-0357-06
铁吸收调节蛋白(ferric uptake regulator,Fur)作为调节细菌中铁离子代谢的重要的蛋白质,是由Fur基因所编码的,是目前研究最为广泛和深入的与铁代谢的相关蛋白质。Fur最初是由Bagg等在大肠杆菌中首先发现的,在铁的代谢中扮演着重要的作用,在细菌体内扮演着维持铁稳态的核心作用,近年来随着技术的不断进步,人们从多个方面对其进行了研究,同时科研人员在其他细菌物种也发现了它的同源蛋白,由于铁是细菌生长的必需元素,因此Fur对于细菌具有重要的作用,研究发现Fur不仅参与了铁的代谢同时参与了细菌体内的多种物质代谢,由此引起了科学家的广泛关注Fur对于铁的具有调节作用,因此在利用铁氧化的生物冶金中具有重要作用,同时Fur与植物致病菌以及人体致病菌中的致病性有着关联性,目前Fur蛋白已经成为研究细菌中铁代谢领域的热点问题之一。
1Fur基因的结构与功能解析
1.1Fur基因的结构
Althaus等认为Fur最初是以一种不带活性的脱辅基蛋白状态存在的,当它与铁离子键合时活性被激活,这个状态是通过键合到一个称之为(Fur box)特殊的序列实现的。在铁离子存在的条件下Fur操纵子与它的启动子在称之为Fur box发生交互作用,Fur盒具有一个GATAATGATAAT-CATTATC共同序列,当添加二价铁离子的时候,Fur的表达受到了cAMP受体蛋白、氧化应激反应刺激这些因素调节。Tiss等基于分光光度法分析发现大肠杆菌的铁调节蛋白的55位酪氨酸,以及Fur box的18位以及19位共识胸腺嘧啶参与了键合。基于Fur与DNA的复合物所提出的构象模型:每个DNA都连接到H4(A52-A64)铁调节蛋白螺旋。同时认为这种内在反应是类似Fur以及它们各自的DNA box所共有的特征,例如锌调节吸收蛋白,镍吸收调节蛋白。
Mark等研究大肠杆菌的Fur时,通过定点突变分别对Fur基因的亮氨酸以及丝氨酸,以及大肠杆菌铁吸收调节蛋白阻遏因子的12个组氨酸以及4个半胱氨酸进行突变。通过研究突变对其体内以及体外造成的影响,发现92位点以及95位点的半胱氨酸残基对于Fur的活性具有重要的作用。然而Wang等对迟钝爱德华氏菌(Ed-wardsiel latarda)的Fur进行定点突变,分析表明C92s以及C95s能够使大肠杆菌的Fur失活,然而92位点以及95位点的半胱氨酸残基的突变对于迟钝爱德华氏菌Fur突变体E112K的Fur表达没有影响。
Stojiljkovic等研究大肠杆菌Fur抑制因子的氮端以及碳端结构域来在启动子识别以及二聚化的功能。研究Fur包含氮端以及碳端结构域融合蛋白具有抑制以及二聚化铁调节蛋白调节lac -Z融合基因的能力。当抑制因子CI857的碳末端熔融,氮末端结构域阻遏铁调节蛋白调节因子lac-Z融合。这两种融合蛋白当铁含量丰富或者铁含量缺少时都能激活,由此认为Fur的氮末端参与到Fur响应启动子的识别,而碳末端参与的是阻遏寡聚化。
1.2Fur的功能解析
Fur的主要生理功能是当铁离子充足时抑制铁吸收,从而维持细菌内的铁平衡。在最新的研究中发现Fur是作为一个核心调控着铁的吸收功能(当铁处于缺乏状态)以及铁储存酶的表达以及铁利用酶的表达(当铁的含量充足的情况下)。
Jose等利用SELEX技术研究从固定相分离得到的DNA键合蛋白家族,结果发现其在保护微生物防止氧化以及营养压力中扮演重要的角色,在硅片中分析启动子区域alr3808,一个从蓝藻(Yanobacteria) sp. PCC7120分离的dps同源表明:铁离子盒子与那些为人所熟知的铁调节蛋白A具有高度的同源性,证据表明通过Fur A调节dpsA主要涉及体内和体外两条途径。EMSA分析表明dpsA启动子区域的Fur具有高度的亲和性,dpsA的表达分析通过插入一个alr1690突变(它会阻遏Fur A的表达增加)结果显示dps A的合成减少。这些研究表明
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