丹参SmNAC1基因的克隆和生物信息学分析.docVIP

丹参SmNAC1基因的克隆和生物信息学分析 　　[摘要] 为了研究丹参中特有的NAC转录子在丹参生长发育、激素调节和抗逆胁迫应答调节中的功能，对丹参NAC转录因子进行了克隆和分析。根据丹参毛状根cDNA文库中筛选到的NAC EST序列，克隆了丹参SmNAC1的cDNA全长序列。生物信息学分析显示基因的开放阅读框591 bp，编码166个氨基酸，相对分子质量21.66 kDa，等电点4.36 Genbank kF006346。SmNAC1蛋白的N-端具有保守的NAC_AB结构域，C-端高度变异。根据软件预测SmNAC1可能定位在细胞核。qRT-PCR分析YE+Ag+处理后SmNAC1在丹参毛状根中的表达变化，处理后2 h表达量上调至对照的1.5倍，4～12 h保持2倍的表达量，36 h时下降至对照水平以下，推测SmNAC1可能参与了丹参毛状根对YE+Ag+的胁迫应答调节。 　　[关键词] 丹参；NAC转录因子；SmBF3-2；分子克隆；生物信息学 　　NAC转录因子是植物中最大的转录因子家族，在植物的生长调节以及逆境应答分子网络中扮演着极其重要的角色，目前为止已经从拟南芥中鉴定出117个NAC转录因子基因[1-2]，水稻中151个[3]，葡萄中143个[4]，毛果杨中163个[5]，烟草[6]和大豆[7]中各有152个。NAC家族转录因子N-端有一个高度保守的NAC结构域，可进一