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Chapter 17 反转录病毒是一个RNA病毒, 具有将它的序列反转录成DNA的能力. 反转录转座子是一个通过RNA形式进行移动的转座子; DNA被转录为RNA, 然后被反转录成DNA, 并被插入基因组新的位点. 这与反转录病毒的不同之处在于反转录转座子没有一个有传染能力的(病毒)形式. 反转录病毒和反转录转座子的繁殖周期包括从RNA到DNA的反转录和从DNA到RNA的转录这个交替过程. 只有反转录病毒能产生感染性颗粒, 而反转录转座子只在细胞内进行活动. 17.2 The retrovirus life cycle involves transposition-like events. 反转录病毒生命周期包括转座事件. 反转录病毒有单链RNA基因组的两份拷贝. 整合的原病毒是双链DNA序列. 反转录病毒通过将其基因组反转录而产生原病毒. 反转录病毒生活周期中, 病毒的RNA基因组经反转录成为双链体DNA, 然后双链体DNA插入宿主的基因组中, 接着, 已整合的DNA再转录出病毒RNA. 17.3 Retroviral genes codes for polyproteins. 反转录病毒基因编码多聚蛋白质. 典型的反转录病毒有3条基因: gag, pol, env. Gag和Pol蛋白是由基因组的全长转录物翻译而来的. Pol蛋白的翻译需要核糖体来进行移码. Env是由剪接过程产生的一种独立的mRNA翻译而来的. 三种蛋白质产物的每一种都可由蛋白酶加工产生出多种蛋白质. 反转录病毒的表达产物为多聚蛋白质, 经过加工后才成为单一蛋白质. 17.4 Viral DNA is generated by reverse transcription. ?反转录产生病毒DNA. 病毒RNA的每一个末端都有短重复序列(R), 因而5?和3?端分别称为R-U5和U3-R. tRNA引物结合到5?端的100-200位点后, 反转录酶开始合成. 当酶到达末端, RNA的5?端就降解, 接着露出DNA产物的3?端. 暴露出的3?端与另一个RNA基因组的3?端配对. 合成继续进行, 其产物两端都产生重复序列, 重复结构为U3-R-U5. 当反转录酶利用DNA产物为模板合成互补链时, 发生相似的链转移. 链转换是重组过程中的拷贝选择机制的一个例子. 反转录病毒RNA末端为同向重复序列, 游离的线性DNA为长末端重复序列(LTR), 原病毒DNA(整合的病毒DNA)两末端是各少两个碱基的LTR. 在反转录过程中, 经过转换模板来产生负链DNA. 正链DNA的合成需要第二次跳跃. 在反转录酶释放其模板并以新的模板继续合成DNA时, 拷贝选择重组就会发生. 原病毒DNA在染色体上的组织与转座子相同, 在靶位点, 原病毒的两侧都有短同向重复序列. 线性DNA被反转录病毒的整合酶直接插入到宿主染色体上. 整合过程中, 反转录病毒序列的两端各丢失2个碱基对. 整合酶是整合反应中唯一需要的酶, 整合过程中, 每个LTR丢失2bp后被插入到靶DNA的4bp重复序列之间. 17.6 Retroviruses may transduce cellular sequences. 反转录病毒能转导细胞基因组序列. 细胞RNA序列代替反转录病毒RNA的部分序列, 这种重组事件会产生转化反转录病毒. 复制缺陷型转化病毒的一段序列被一段宿主序列替换, 这种病毒可以在一个功能正常的辅助病毒帮助下完成复制. 通过病毒基因组的整合和缺失, 产生一个融合的病毒-细胞转录物, 它能被包装到正常的病毒RNA基因组, 从而产生了复制缺陷型病毒. 非同源重组是产生缺陷型的转化基因组所必需的. * RETROVIRUSES AND RETROPOSONS 反转录病毒和反转录转座子 17.1 引言 17.5 Viral DNA integrates into the chromosome. 病毒DNA整合到染色体中. A retrovirus is an RNA virus with the ability to convert its sequence into DNA by reverse transcription. A retroposon (retrotransposon) is a transposon that mobilizes via an RNA form; the DNA element is transcribed into RNA, and then reverse-transcribed into DNA, which is inserted at a new site in the genome. The difference from retroviruse
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