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利用生物信息学方法开发鹌鹑微卫星标记 白俊艳，庞有志，赵淑娟 （河南科技大学动物科技学院，471003） 摘要：本研究对已公布的鹌鹑核酸序列和EST序列总计635条序列中1～6核苷酸重复SSR的分布进行了分析。结果表明，其中共发现120条SSR，检出率为18.9%。二核苷酸重复基元的SSR占40.0%，三核苷酸重复基元的SSR占35.8%，五核苷酸重复基元和四核苷酸重复基元的SSR类型，分别占14.2%和10.0%，没有发现六核苷酸重复基元的SSR。组成这些SSR的主要基序有AT/TA，CA/GT，GA/CT，CAG/GTC，AGG/TCC，TAA/AAT，GGC/CGG，GAC/CTG，CGA/GCT，GCA/CGT，GAG/CTC，ACC/CCA，TCTT，TTTG，TCCA，ATGAT/ATCAT，TCCCT，TTCCC。并且SSR的重复次数都在5以上，由此可以推测利用鹌鹑核苷酸序列和EST序列中的SSR序列将有可能开发一批有价值的SSR分子标记供各种研究所用，还有助于鹌鹑高密度遗传图谱的构建、重要功能基因克隆及基因功能等研究。 关键词：鹌鹑；微卫星；生物信息学方法 鹌鹑分为野生鹌鹑和家养鹌鹑两类。野生鹌鹑主要有野生普通鹌鹑和野生日本鸣鹑两种野生普通鹌鹑。鹌鹑具有体型小、产蛋能力强、繁殖快、易饲养、耗料少等特点，因而具有较高的经济价值，同时还因其敏感性好、世代间隔短，