微生物第5章分类与鉴定课件.pptVIP

微生物鉴定与分类 一、生物的系统发育和进化 1、对生物分类的两种原则： 传统：根据表形特征的相似程度分类。 重在应用，不以反应生物之间的进化关系为目的 现代：通过比较不同物种间基因序列的相关性来类， 目的是探寻各物种间的进化关系，建立反映生 物发育相关性的分类系统。 2、传统的分类体系 1753年：瑞典人林奈（Carrolus Linneaus） 两界分类系统：生物 动物 植物 1969年： 惠特克 （R.H. Whittaker）： 原核生物界：细菌、蓝细菌 原生生物界：原生动物、单细胞藻类 五界系统 真菌界：真菌、酵母菌 植物界 动物界 3、反映生物系统发育相关性的进化计时器 生物A A、B间的 生物B 进化关系 理想的生物进化计时器应具备的条件：见书 原核生物核糖体（70S） ： 大亚基（50S）：蛋白质 + 23SrRNA + 5SrRNA 小亚基（30S）：蛋白质 + 16SrRNA 真核生物核糖体（80S） ： 大亚基（60S）：蛋白质 + 28SrRNA + 5~5.8 SrRNA 小亚基（40S）：蛋白质 + 18SrRNA 20世纪70年代，沃斯（Carl Woese）根据生物核糖体中 18SrRNA 和 16SrRNA 的碱基序列将生物划分为3个 “域（domain)“ 或称 “原界”： 古细菌原界（Archaea）： 甲烷菌，嗜盐菌，嗜热菌等 真细菌原界（Bacteria）： 除古细菌外的其它原核生物 真核生物原界(Eukarya)：原生生物、真菌、动物、植物 生物的三原界系统发育树 二、微生物的分类单元和命名： 1、种以上的微生物分类单元： 界（Kingdom）、门（Phylum）、 纲（Class）、目（Order）、 科（Family）、属（Genus）、 种（Species） 2、对于微生物来说，种的概念： 表型特征和包括16SrRNA在内的基因序列特征高度相似的菌株群，而且这个菌株群和其它类群有明显差异。 3、种以下的分类概念： 菌株（strain）、模式菌株（typestrain） 亚种（subspecies） 型（form）：生物型、血清型、噬菌体型…… 4．菌种学名 （1）按《国际细菌命名法规》命名的，国际公认，通用的正式菌种名字。采用林奈的双名法： 学名：属名+种名加词 （字母均为斜体） 属名：拉丁文或希腊文，名词，单数，第一个字 母大写，描述微生物的一般的、主要的特性。 种名加词：拉丁文或希腊文，形容词，字母小写， 描述该菌种具体、次要特征。例： 金黄色葡萄球菌：Staphylococcus aurous 结核分枝杆菌：Mycobacterium tuberculosis 如果泛指某一属的微生物，或某菌种，知其属但种名未定，可用“sp” “spp”作加词： Bacillus sp: 一个尚未定名的芽孢杆菌 Bacillus spp: 泛指芽孢杆菌属的菌种 （2）种以下分类： 亚种（subspecies, subsp）指某一明显而稳定的特征与模式种不同的种，例：蜡状芽孢杆菌的蕈状亚种： Bacillus cereus subsp. Mycoides 变种（Variety, Var）:现不正式使用，枯草芽孢杆菌黑色变种： Bacillus subtilis var. niger 菌株（strain）: 由一个独立的单细胞繁殖形成的微生物纯种群体，使用较广泛。某菌种的菌株名称加在菌种学名之后，可任意取名，例： 华癸中生根瘤菌 7653R菌株：