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第十五章 真核生物基因的表达调控 原核基因组中除rRNA、tRNA基因有多个拷贝外,重复序列不多。哺乳动物基因组中则存在大量重复序列(repetitive sequences)。用复性动力学等实验表明有三类重复序列: ①高度重复序列(high repetitive sequences),这类序列一般较短,长10-300bp,在哺乳类基因组中重复106次左右,占基因组DNA序列总量的10-60%,人的基因组中这类序列约占20%,功能还不明了。 ②中度重复序列(moderate repetitive sequences),这类序列序列多数长100-500bp,重复101-105次,占基因组10-40%。例如哺乳类中含量最多的一种称为Alu的序列,长约300bp,在哺乳类不同种属间相似,在基因组中重复3-5×105次,在人的基因组中约占7%,功能也还不很清楚。在人的基因组中18S/28SrRNA基因重复280次,5SrRNA基因重复2000次,tRNA基因重复1300次,5种组蛋白的基因串连成族重复30-40次,这些基因都可归入中度重复序列范围。 ③单拷贝序列(single copy sequences)。这类序列基本上不重复,占哺乳类基因组的50-80%,在人基因组中约占65%。绝大多数真核生物生物为蛋白质编码的基因在单倍体基因组中都不重复,是单拷贝的基因。 原核生物的基因为蛋白质编码的序列绝大多数是连续的,而真核生物为蛋白质编码的基因绝大多数是不连续的,即有外显子(exon)和内含子(intron),转录后需经剪接(splicing)去除内含子,才能翻译获得完整的蛋白质,这就增加了基因表达调控的环节。 基因表达=基因转录+翻译 基因表达的调控: 生物体随时调整不同基因的表达状态,以适应环境、维持生长和发育需要。 主要是转录水平的调控 基因转录的调节: 1.DNA序列 2.调控蛋白 RNA聚合酶 3.DNA-蛋白质相互作用 活性的影响 如水蜡虫(Pseudococcus nipae)的异染色质化 水蜡虫(2n=10)在体细胞里来自父本的5条染色体依次被异染色质化,在精子形成时丢失,只保留来自母本的5条染色体。 剂量补偿(dosage conpensation) 雌性哺乳动物X染色体的失活 X-连锁的6-磷酸葡糖脱氧酶(G-6-PD)的测定也为莱昂假设提供了有力证据。女性虽然有二条X染色体,但其G-6-PD活性和男性的相同,表明其X染色体的总量有一半是失活的,这正好说明了剂量补偿作用。G-6-PD有A,B两种类型,二者之间只有一个氨基酸的差异,但电泳带的迁移率不同,A带比B带移动得快一点。它们分别由一对等位基因GdA和GdB编码。GdA或GdB纯合的女人从各种组织取样进行电泳分析都只出现一条电泳带。GdA/GdB杂合的女人电泳的结果却会出A、B两条带。 三色猫(又叫做玳瑁猫)也是一个很好的例子。雌性的三色猫腹部的毛是白色的,背部和头部的皮毛由桔黄色和黑色斑组成。这种雌猫是一个X-连锁基因杂合体,X-连锁的b基因控制橙色毛皮,其等位基因B是控制黑色的毛皮。带有b基因的X染体若失活,B基因表达,产生黑色毛斑,若带有B基因的X染色体若失活,b基因表达,则产生橙黄色毛斑。 二、 DNase的敏感性和基因表达 当一个基因处于转录活性状态时,含有这个基因的染色质区域对DNaseⅠ(一种内切酶)降解的敏感性要比无转录活性区域高得多。这是由于此区域染色质的DNA蛋白质结构变得松散,DNaseⅠ易于接触到DNA之故。 用DNAaseI来鉴别基因的活性 胚胎?-球蛋白基因 DNaseⅠ敏感区的范围随着基因序列的不同而变化,从基因周围几个kb到两侧20kb大小不等。仔细分析具有转录活性基因周围的DNA区域,表明有一个中心区域存在,称为超敏感区域(hypersensitive region)或超敏感位点(hypersensitive site),它对DNaseⅠ是高敏感的。 用DNA酶Ⅰ处理染色质可以得到酸溶性的DNA片段,而且处理时间越长,产生酸溶性DNA的比例越大,直到全部染色质都被降解掉。用特定基因的cDNA或mRNA作探针,可以测定某个基因被 DNA酶Ⅰ降解的情况。当总体 DNA的 10%被降解成酸溶性物质时,50%以上的活跃表达基因已优先降解了。 超敏感位点是一段长200bp左右的DNA序列,这些区域是低甲基化区;并可能有局部解链的存在;不存在核小体结构或结构不同寻常,此区因DNA的裸露易和多种酶或特异的蛋白质结合,也就是说易于和反式作用因子结合。
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