RNA的剪接机理.docVIP

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RNA的剪接机理

摘要酶母tRNA的剪接 自身剪接反应 能够编码蛋白质的内含子 细胞核中的剪接连接点 套索的产生 snRNAs的作用 核内不均一RNA酶母tRNA的剪接RNA的剪接就是要把断裂基因的转录本中的内含子除去。酵母细胞核中400个tRNA基因中约有40个是断裂基因。不同氨基酸的tRNA基因中的内含子不相同,因此,剪接酶类看来并不能识别任何共同顺序......酶母tRNA的剪接   RNA的剪接就是要把断裂基因的转录本中的内含子除去。酵母细胞核中400个tRNA基因中约有40个是断裂基因。这些基因均只有一个内含子,位于与反密码子的3侧相隔一个核苷酸之处,长度为14至46bp。不同氨基酸的tRNA基因中的内含子不相同,因此,剪接酶类看来并不能识别任何共同顺序。所有内含子中均有一段与tRNA的反密码子互补的序列,因而使反密码臂的构象发生了改变,即反密码子被配对而使反密码臂伸长了很多。在前体中仅反密码臂受到影响,tRNA分子的其他部分仍保持其正常结构。   酵母tRNAphe中的内含子能与其反密码子碱基配对,从而改变了反密码臂的结构。此剪切过程可分为两个阶段。第一步是磷酸二酯键的断裂,这不需要ATP。这一步由一种内切核酸酶所催化。第二步是连接反应,需要ATP的存在,由RNA连接酶所催化。在无ATP时,产生的两个tRNA半分子不能连接起来。这两个半分子具有独特的末端:其5端有OH基,而3有一个2,3-环磷酸基。当加入ATP时,即发生第二步反应:两个tRNA半分子先发生碱基配对,形成成熟tRNA分子的构象,然后由RNA连接酶形成磷酸二酯键而将两个半分子共价连接起来。2,3-环磷酸基的存在并不限于酵母,在植物和哺乳动物的tRNA剪接反应中也有环状基团的产生。在人的HeLa细胞中,RNA连接酶能将带有2,3-环磷酸基的RNA和另一带有5-OH基的RNA直接连接起来。酵母tRNA前体也可以在爪蟾的卵母细胞核提取液中正确地被剪接。这表示剪接反应没有种属特异性。爪蟾具有能识别酵母tRNA的内含子的酶类。 自身剪接反应? ?   以前一直认为只有蛋白质有酶活性。这个概念在生物化学界已根深蒂固。然而近期发现RNA也可有酶活性。这种有酶活性的RNA有人称之为ribozyme。? ?   一种四膜虫Tetrahumenathermophila的两个主要rRNAs的基因和其他真核生物相类似(见前文),被转录在同一个初级转录本中。此转录本称为35S前体RNA,较小的rRNA的序列在5侧,较大的rRNA(26S)序列则在3侧。在编码26SrRNA序列存在一个单一的,短的(约400bp)内含子。如将这个35S前体RNA在体外温育,可以发生自动剪接作用:内含子从前体中被切出,先呈线性RNA片段,后来又环化为环状RNA。这个反应仅需要加入一种一价阳离子,一种二价阳离子,和一种鸟嘌呤核苷酸(G)。其他碱基均不能代替G.但并不一定需要GTP;GDP;GMP和鸟苷都可以应用。这表示此反应并不需要能量供应。此外,此鸟嘌呤核苷酸必须有一个游离的3-OH基。这个G要连接到内含子的5端上(通过通常的磷酸二酯键)。当线性的内含子成为环状时,其3端可连接在距离5端15个核苷酸之处,从而将原来5端和15个碱基的节段(包括G在内)排除出去。这种反应基本上是一种磷酸酯转移反应。外显子A的3-OH基可直接和外显子B的5端相连接。亦即一个磷酸酯可以直接被转移到另一个上去,不需要经过中间步骤(如水解作用之类),因此磷酸酯键的能量被保存着。这解释了为什么此反应不需要水解ATP或GTP来供应能量。同时,两次磷酸酯转移反应似乎是紧密相连的,因为始终没有找到过游离的外显子(A或B)。而线性内含子的环化则可以被看作是第三个磷酸酯转移反应。在体外系统中进行剪接时,并不需要蛋白质的存在。RNA有能力自行剪接,故称为自身催化作用(auto catalysis)。   T.Cech和S.Altman各自独立地发现RNA具有催化作用。从而改变了生物催化剂的传统概念。为此他们共同获得了1989年Nobel化学奖。1978年Altman从纯化的RNA酶P中分离出一种多肽和一种RNA(M1RNA)。最初的实验结果表明,蛋白质和M1RNA单独都没有酶活性,但二者混合在一起又可恢复活性。其它生物材料的实验结果表明M1RNA是RNA酶P活性所必须的。1983年Altoman证明,在较高浓度的Mg2+存在下,单独的M1RNA就可以催化tRNA前体的成熟,而单独的蛋白质则没有这种能力。这样,RNA即可看作是个酶。事实上,M1RNA的酶活性并不比RNA酶P的粗制品的活性低。原来认为蛋白质赋予酶的活性,RNA只起某种辅助作用(例如帮助蛋白质与其底物结合),但现在发现这两种功能已经倒转。Cech给具有催化活性的RNA定名为ribozyme。   

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