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生物工程信息检索期末作业.
文献检索期末作业
一.首先大体介绍一下我的课题:
我的课题:杂色云芝菌产漆酶的发酵优化
我的课题研究背景:
漆酶(laccases),是一种含铜的多酚氧化酶,与植物抗坏血酸氧化酶、哺乳动物血浆铜蓝蛋白和胆红素氧化酶等同属蓝色多铜氧化酶家族。按漆酶来源可分为漆树漆酶和真菌漆酶两大类。
漆酶在真菌、植物、原核生物等都有发现,特别是在大型真菌如担子菌、子囊菌和半知菌等中发现较多。此外,在高等动物中也有发现,如最近Ferrer等从牛胃中鉴定获得一新的漆酶。本文我所研究的产漆酶真菌是杂色云芝菌,其属于丝状真菌白腐真菌类,
漆酶不但具有氧化酚类,芳胺类化合物、与木质素有关的非酚类化合物的能力,氧化高难降解的环境污染物的能力,还具有特殊的催化性能,能催化有机物的合成。与化学氧化相比,由于生物氧化具有特异性、可降解性,以及反应条件的温和性等优点,大大的节约了能源和成本,使得漆酶在工业,农业和生物技术领域具有广阔的应用前景。漆酶的应用很广泛,是一种重要的酶制剂,但是研究其存在的最大问题就是酶活较低,所以我的课题的研究就是如何较大幅度的提高漆酶酶活。
漆酶的生产方法主要是真菌发酵法,包括液体发酵和固体发酵。目前研究较多的是深层振荡液体发酵。液体发酵产漆酶条件研究的主要内容有:营养因子、非营养因子的优化及诱导剂的筛选等。营养因子主要包括碳源、氮源、无机盐、微量元素和维生素等;非营养因子主要有pH,温度等。所以本课题重点就是从营养因子,对该菌产漆酶酶活的影响进行探索,试图找到该菌产漆酶的最优条件。
下面举一例对研究课题时,进行文献检索的过程进行分析。
案例分析一
课题研究,需要检索:杂色云芝菌产漆酶的发酵优化
我的检索思路为:图书阅读→中文检索→外文检索→整理思路确定,实验方向
2.1首先进行图书阅读,大体了解课题的相关内容。
选择超星电子图书
选择其理由:超星电子图书(百万包库)远程访问,图书资源100万种,涵盖中图法22大类,基本涵 盖了近几年出版的所有图书。
⑴ 进入超星电子图书界面,在高级检索中输入关键词“漆酶优化”“真菌培养”,都没有找到相关图书:
⑵ 所以打算直接检索“真菌”,再检索“酶”,试图找到相关图书,找准其中几本图书,点击阅读器进行阅读或者网页阅读,对真菌的培养,生长和酶活测定,产酶条件进行大体的了解。
2.2 进行中文检索。
选择CNKI中国知网。
选择其原因:是因为中国知网的学术期刊、其中有国内相关资源最完备、高质量、连续动态更新的中国优秀硕士学位论文全文数据库,让我们了解自己课题的进展方向。
A、CNKI检索过程
⑴ 打开南京工业大学图书馆,选择中文数据库,点击总库平台,进入知网主页。
⑵ 选择高级检索,进入高级检索页面,提高自己检索的查全查准率。
考虑课题:杂色云芝菌产漆酶的发酵优化 的核心内容为:漆酶优化
选取主题选项,在后面输入框中输入:(漆酶),后并含框中输入(优化),后在匹配中选择模糊。
⑶ 检索结果,发现有522篇相关的文献,其中有多数与我的课题中心:白腐菌产漆酶优化的相关性不大,估计参考值较低,故需要修改检索策略。
⑷修改的检索策略:在漆酶优化这个检索条件的基础上,有添加了3个检索
条件,为了能对相关文献查的更全更准确。具体分析:我的课题主题是漆酶优化,但是好多文献的说法还可以说成:对产漆酶条件的探索,故漆酶优化的同义可为漆酶条件,两者的关系选择或含;出于想缩小范围,更加准确的检索的目的,我又添加另一关键词:白腐真菌,而白腐真菌有是一种丝状真菌,两个为同义;这四个输入内容均为词组,我都为它们匹配为精确。故我确定的布尔逻辑如下图。
一共检索出26结果。
(5)点击进入一篇文章,查看相对应的摘要,和我所研究的课题主题相关性很大,选择CAJ:
检索完成。
2.3 前期运用中国知网:对杂色云芝菌产漆酶的发酵优化这个主题的现阶段研究成果、进展、未来趋势和方向有了较为全面认识,但是想对自己下阶段的实验计划和实验方案有创新突破,还需进一步阅读大量的外文文献,所以决定继续进行外文检索。
选择Web of Science 检索
选择原因是:该数据库收录国外核心期刊比较全面,在国内外的数据库中处于高影响的地位,对自己的论文设计有很大的用处。
Web of Science检索过程
⑴ 打开Web of science 界面,添加另两个字段,输入关键词“laccase ”、“optimization” or“white-rot fungus”,它们的逻辑顺序均为and:
(2)检索结果,共有143条记录,选择排序方式为“相关性”,找到和自己检索主题相关性较大的文献:
⑵ 点击进入任意一条记录
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