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转录激活因子 通用转录因子(TFⅡA、TFⅡB、TFⅡD等)能够识别转录起始位点并指示转录方向,但他们自身只能激发很低的转录水平(本底水平转录),而细胞中活跃基因的转录通常高于本底转录。 为了能够增强转录,真核细胞另有一类与增强子结合的基因特异性转录因子即激活因子(activator),由激活因子产生的转录激活使得细胞能够调控基因的表达。 DNA结合域与转录激活域 转录激活因子既可以激活也可以抑制RNA聚合酶Ⅱ的转录它们至少都含有两个基本的功能域:DNA结合域和转录激活域。 DNA结合域:它是同DNA结合的特殊序列,如基因附近存在的启动子和增强子序列结合的区域,与转录调节直接相关 转录激活域:和其他转录调节因子结合的区域。 另外:还有一些激活因子具有形成二聚体的域,能使两个单体彼此结合形成同源二聚体、异源二聚体或多聚体。它们可以与附加的小分子结合来调控转录因子自身的活性。 DNA结合域 每种DNA结合域都有一个DNA结合模体,模体是结构域的一部分,具有特定的形状一结合特定的DNA。DNA结合模体可大致分为三类:含锌结构域、同源结构域和碱性结构域。 含锌结构域:利用一个或多个锌离子形成合适的构象,使DNA结合模体的α螺旋能进入DNA双螺旋的大沟,并结合在特定的位置上。也分为三种:一种“C2H2”型锌指、“C4”型和“C6”型 含锌结构域 C2H2型:即锌指,有一个12个氨基酸的环,通过两个半胱氨酸和两个组氨酸残基固定,这四个残基与锌离子在空间上形成一个四面体结构。它在TFⅢA中重复了9次,在SP1中有3个拷贝。一般来说须要三个或更多这样的锌指结构才能与DNA结合。 含锌结构域 C4型:锌离子与四个半胱氨酸结合,存在于细胞核受体中,与跨膜扩散的内分泌信号分子(类固醇和其他激素分子)相互作用,形成激素-受体复合物并结合到增强子或激素响应元件上激活相关基因的转录。 这类激活因子必须结合一个效应分子(激素分子:如性激素、孕酮、糖皮质激素、甲状腺激素等)才能发挥作用。 含锌结构域 C6型:含2个锌离子和6个半胱氨酸组件,在酵母转录激活因子GAL4及其家族成员中出现。GAL4蛋白的结合模体类似锌指,也包含锌离子和半管氨酸残基,但没有组氨酸,锌离子与帮胱氨酸的比例是1:3 同源结构域 同源结构域:由于它编码的基因的区域为同源框而得名。每个同源结构域蛋白包括3个α螺旋,第二、第三螺旋形成螺旋-转角-螺旋模体,第三个螺旋作为识别螺旋起作用大多数同源结构域蛋白的N端还有一个不同于螺旋-转角-螺旋的臂可插入DNA小沟。 同源框:最早发现于果蝇的被称 为同源基因的调控基因中该基因 的突变会引起果蝇肢体的移位畸 形。 碱性结构域 碱性结构域:具有这种结构域的转录激活因子均有一个强碱性DNA结合模体,与1或2个蛋白质二聚化结构域连接,与碱性结构域相连的二聚化结构域分为两类:亮氨酸拉链(ZIP)和螺旋-环-螺旋(HLH)。 二聚体结构域 亮氨酸拉链:该域由两条多肽链组成,α螺旋中每隔7个氨基酸就出现一个亮氨酸残基(或其他疏水性氨基酸),这些残基位于DNA结合域的C端α螺旋上,这种排列有利于两个单体间的相互作用,形成二聚体。每个α螺旋相连的碱性结构域形成一个对称的结构,沿DNA相反的方向延伸并与对称的DNA识别位点发生作用,最终像夹子一样夹在DNA上。 螺旋-环-螺旋域:总体结构域亮氨酸拉链类似,只是它的两个α螺旋被一个非螺旋的多肽环分成两个单体蛋白,C端α螺旋的疏水残基可以二聚化。 大部分激活因子只含有一个转录激活域,有些则有几种激活域。大多数转录激活域可以分为以下3种。 酸性域:由49个氨基酸组成的激活域中,有11个氨基酸为酸性氨基酸。 富谷氨酰胺域:SP1转录激活因子有两个这样的功能域,谷氨酰胺占该区氨基酸总数的25%,谷氨酰胺残基所占的比例似乎比总体结构更重要。 富脯氨酸域:如AP2、Oct-2等转录因子中所发现的富含脯氨酸结构域,有一个能激活转录的连续的脯氨酸残基。 阻抑物结构域 转录的阻抑有可能是通过间接的对激活因子功能的干扰而实现,有以下几种情况: 1.阻断了激活因子DNA的结合位点 2.非DNA结合复合体的形成,如类固醇激素受体的阻抑蛋白 3.掩盖了激活结构域 4.阻抑蛋白的特殊结构直接抑制转录 转录调控的对象 不同的转录激活域有着不同的调控对象,有以下几种: 1.染色质结构 2.通过特定的TAFⅡ与TFⅡD作用 3.与TFⅡB作用 4.对TFⅡH复合体的调整和作用导致RNA聚合酶Ⅱ的CTD的特异性磷酸化。 组成性转录因子SP1 SP1存在于所有的细胞类型中,与GC盒结合,包含3个锌指结构和2个富含谷
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