第六章细菌的分类及命名-生物探索.ppt

细菌的分类及命名 一、 细菌的分类地位 二、 细菌的命名 三、 细菌分类鉴定的标准 四、 细菌的分类体系 五、 细菌的鉴定 二、细菌的分类地位 1、过去属于植物界， 现在划为：原核生物 在兽医微生物中，古细菌不占重要地位 2、细菌还包括 衣原体、立克次氏体、霉形体、螺旋体、放线菌等→对动物和人具有致病作用 蓝细菌、紫色光合细菌等 界 Kingdom (拉：Regnum) 门 Phylum (拉：Phylum)) 纲 Class (拉：Classis) 目 Order (拉：Ordo) 科 Family (拉：Familia) 属 Genus（拉：Genus） 种 Species（拉：Species） 1、属（genus）性状相近、关系密切的若干菌种组成一个菌属，与其他属有明显差异。 2、种（species）是细菌学分类的最基本单元，生物学性状基本相同的细菌群体归成一个菌种。 3、菌株（strain）是不同来源的某一种细菌的纯培养物。 三、细菌的命名 1、细菌的命名依据“国际细菌命名法规”(The International Code of Nomenclature of Bacteria) 学名用拉丁文，遵循“双名法”。 每一种细菌的拉丁文名称由属名和种名两部分组成如：产气荚膜梭菌（Clostridium perfringens） 属名在前，字首字母要大写，其余小写 整个属名及种名在出版物中应排成斜体 中文译名，种名在前，属名在后 2、分类学文献中的细菌拉丁文学名，属名和种名之后，往往还要加上首次定名人（加括号）、现名定名人和现名定名年份，这些均用正体排字。 一般兽医学及医学微生物学文献中，属名和种名之后的部分均予省略。 如：Escherichia coli 例如 大肠埃希菌的学名全名是：Escherichia coli(Migula) Castellani et Chalmers l919 指的是Migula于1895年命名此菌为Bacillu coli，Castellani及Chalmers于1919年改为现名。 金黄色葡萄球菌的学名为： 3、拉丁文学名应按拉丁文字母的发音规则读念 4、属名重复出现时，拉丁文可缩写，用第一个字母，为避免混肴，也可用2个字母。大肠杆菌(E.coli) 5、只确定属名、未确定种名的某一株细菌，其拉丁文学名可在属名之后加sp．(正体字)；如果同属未定种名的若干菌株，则用spp． (species 的缩写， sp. 表示单数，spp. 表示复数 ) ， 如 Micrococcus sp.表示微球菌属的一个种， Micrococcus spp. 表示微球菌属的一些种。 6、如果是新种，在新种的拉丁文学名之后还要加上“sp.nov。”，nov是novel的缩写。 例如Lawsonia intracellularis gen．Nov. sp . Nov.，译为：胞内劳森菌，新属新种。 7、亚种用subsp.(正体字)表示，这是subspecies的缩写， 例如Pasteurella multocida subsp．septica，中译名为多杀性巴氏杆菌败血亚种。 四、细菌分类鉴定的标准 1、长期以来，细菌分类鉴定的主要依据是其表型(phenotype)特征 2、目前微生物学界普遍考虑的分类依据是细菌的种系发生关系(phylogenetic relationship)，即分析其基因特征从而确定分类地位。 研究细菌的种系发生关系主要采用三种方法： 1）测定DNA碱基(G+C)mol％ 2）核酸分子杂交 3）16SrRNA寡核苷酸编目 五、细菌的分类体系 细菌分类体系主要是“伯吉氏系统细菌学手册”，Holt（美国）编共4卷。及“伯吉氏细菌鉴定手册” 国际系统与进化微生物学杂志是细菌分类命名世界公认权威为期刊。 国际公认的菌种保藏权威机构是“美国典型培养物保藏中心(ATCC) ”以及“德国微生物及细胞保藏中心(DSM) ”等。我国兽医微生物菌（毒）种由中国兽药检察所鉴定保存。 五、细菌的鉴定 纯培养细菌才能进行鉴定。DNA分子水平的鉴定主要限于专业实验室； 常规细菌鉴定沿用表型特征检测方法； 有成套检测指标的快速诊断试剂盒 商品化的细菌鉴定试剂盒有Enteotube系统、API系统、Vitek系统等。 有条件的单位可用PCR技术检测鉴定 1、分类方法 数值分类法：根据细菌的各种性状的数值分析，借助计算机，将拟分类的细菌按其性状的相似程度归类定位。 在进行数值分类时 需要选择分类单位（菌株、种或属）→将性状编码→按公式计算出相似度（S矩阵） →进行系统聚