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蛋白质的结构与功能
第二章 蛋白质的结构与功能Chapter 2 Structure and Function of Protein 蛋白质(protein)是由氨基酸为单位组成的一类重要的生物大分子,是生命的物质基础。 第一节 蛋白质通论 蛋白质的组成与分类 蛋白质的大小与分子量 蛋白质的构象 蛋白质的功能 第二节 蛋白质的组成-氨基酸 组成蛋白质的基本单位是氨基酸。 天然的蛋白质完全水解,最后都可得到约二十种不同的氨基酸。除脯氨酸和甘氨酸外,其余均属于L-α-氨基酸。 氨基酸的功能 (1)、组成蛋白质 (2)、一些aa及其衍生物充当化学信号分子 ?-氨基丁酸,色氨酸衍生物:5-羟色胺、褪黑激素,都是神经递质,甲状腺素(Tyr衍生物) ,吲哚乙酸(Trp衍生物)都是激素 (3)、氨基酸是许多含N分子的前体物 核酸的含氮碱基、血红素、叶绿素的合成都需要aa (4)、一些基本氨基酸和非基本aa是代谢中间物 精氨酸、瓜氨酸、鸟氨酸)尿素循环的中间物, 基本氨基酸(编码的蛋白质氨基酸):组成蛋白质,20种, 稀有氨基酸:是多肽合成后由基本aa经酶促修饰而来。 非蛋白质氨基酸:存在于生物体内但不组成蛋白质 (约150种)。 二、基本氨基酸的分类: 根据R侧链基团性质的不同,可将氨基酸进行分类 杂环氨基酸、芳香族氨基酸与脂肪族氨基酸 极性氨基酸与非极性氨基酸 1、按照R基的化学结构分类 (1)、R为脂肪烃基的氨基酸(5种) (2)、 R中含有羟基和硫的氨基酸(共4种) (3)、?????? R中含有酰胺基团(2种) (4)、 R中含有酸性基团(2种) (5)、 R中含碱性基团(3种) (6)、? 芳香族氨基酸 (7)、杂环族氨基酸(1种) 2、极性分类可分为: 非极性氨基酸:Ala,Val,Leu,Ile,Pro,Phe,Try,Met。 极性氨基酸:Gly,Tyr,Cys,Ser,Thr,Asn,Gln;Lys,Arg,His;Asp,Glu. 三、氨基酸的理化性质: 1.两性解离及等电点: (1) 氨基酸在晶体和水溶液中主要以兼性离子形式存在 ①晶体溶点高 → 离子晶格,不是分子晶格。 ②不溶于非极性溶剂 →极性分子 ③介电常数高→ 水溶液中的氨基酸是极性分子。 (2) 氨基酸的两性解离和酸碱滴定曲线 HA → A- + H+ pH=pKa/ +Log[A-]/[HA] pKa/ 就是HA50%解离([碱] = [酸])时溶液的pH值,Ka/就是此时溶液的[H+] 当HA50%解离时,溶液的pH值等于pKa/ pH = pKa/ 时,[碱] = [酸](50%解离) pH pKa/ 时,[碱] [酸](>50%解离) pH pKa/ 时, [酸] [碱](<50%解离) 氨基酸分子是一种两性电解质。 通过改变溶液的pH可使氨基酸分子的解离状态发生改变。 氨基酸分子带有相等正、负电荷时,溶液的pH值称为该氨基酸的等电点(pI)。 2.紫外吸收性质: 组成天然蛋白质分子的20种氨基酸中,只有色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸对紫外光有光吸收。其吸收峰在280nm左右,以色氨酸吸收最强。 可利用此性质采用紫外分分光度法测定蛋白质的含量。 ?? 氨基酸的光吸收性 Tyr、Phe、Trp的R基含有共轭双键,在220-300nm近紫外区有吸收。 λ(nm) ε Tyr 275 1.4×103 Phe 257 2.0×102 Trp 280 5.6×103 3.氨基酸的化学反应 (1)氨基参与的反应 与亚硝酸反应(Van Slyke 法测定氨基酸) Sanger 反应?:2.4一二硝基氟苯(DNFB) Edman反应:苯异硫氰酸酯,PITC ?生成西佛碱的反应(Schiff):西佛碱是某些酶促反应的中间产物(如转氨基反应的中间产物)。 甲醛反应 (2)羧基参与的反应 1、成盐、成酯反应 2、成酰氯的反应 氨基被保护后,羧基可与二氯亚砜或五氯化磷反应,生成酰氯, 使羧基活化,在多肽的人工合成中常用。 3、叠氮反应 :活化羧基,可用于肽的人工合成 4、脱羧基反应:Glu脱羧形成γ-氨基丁酸 (3)α-NH2和α-COOH共同参加的反应 与茚三酮反应 茚三酮在弱酸中与α-氨基酸共热,引起氨基酸的氧化脱氨,脱羧反应,最后,茚三酮
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