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微生物能治疗一切? 美国白宫科技政策办公室副主任乔?汉德尔斯曼 人体“第二基因组”   今年5月13日,继脑计划、精准医学、抗癌登月计划之后,奥巴马政府宣布启动“国家微生物组计划”。根据白宫公布的计划,美国政府将在未来两年投入1.21亿美元“国家微生物组计划”联邦专项资金作为启动资金。除了联邦机构外,还有数十所大学和研究机构将加入“国家微生物组计划”,它们将在未来几年投入总共4亿美元的启动资金。   白宫科技政策办公室副主任乔?汉德尔斯曼在13日的白宫会议上指出,奥巴马政府的一些优先领域,比如精确医学、可再生能源、农业与气候变化等,都与微生物组有“强烈关联”。汉德尔斯曼原本是一名微生物学家,她将在今年7月重返耶鲁大学的实验室继续搞研究。“国家微生物组计划的推动,她功不可没。”上海交通大学微生物学教授赵立平说。赵立平是国内最早进行肠道菌群和疾病研究的人之一。   微生物无处不在。我们的身体就是一座微生物大熔炉,居住着数以万亿计的细菌,帮我们维持健康。2007年底,美国推出人类微生物组计划,随访了242例健康人群,定期从口腔、鼻腔、皮肤等身体18个部位取样,得到了健康人身上几乎全部微生物的微生物组“普查”结果。   我们被1万种微生物寄居着,这些外来者的细胞数量是我们的10倍,重量大约1.5公斤,与我们的大脑差不多一样重。这些微生物大部分居住在肠道里,除此之外口腔中也有很多,比如变形链球菌被认为是蛀牙的主要原因。微生物群落在不同人之间有广泛的差异,相对来说,不同人口腔中的微生物差异比其他部位要小。一项在丹麦和西班牙进行的研究发现,至少有1000种不同种类的肠道微生物,但是平均到每个人只有160种。   虽然身体每个部位的微生物对健康来说都很重要,但是肠道微生物组却被认为是人体最主要的微生物组,因为这一微生物群落能帮助我们消化食物,为细胞的新陈代谢提供能量,直接与我们的免疫系统相互作用。肠道内上千种和人类共生的微生物,其遗传信息的总和叫作微生物组,也被称为元基因组或者宏基因组,它们编码的基因超过400万个。相比之下,人类基因组总共编码了2.5万个基因。   自1953年,詹姆斯?沃森和弗朗西斯?克里克成功描述了DNA的结构,我们开始把基因视为我们的生物学命运缔造者。DNA双螺旋提供生命的蓝图,这个过程相当复杂也很简单:基因合成蛋白质,蛋白质组成我们的各部分。当DNA被破坏或者基因之间的相互作用出现问题,最终会导致疾病。如今,了解基因如何、何时发生故障,如何预防、治疗从普通感冒到癌症之类的疾病已经成为分子生物学的中心任务。在过去的10年中,借助于计算机处理和基因测序技术的快速升级,基因组测序成为现实。随着技术发展,另一个真相也开始显现:虽然我们的健康受基因的影响很大,但是很大程度上它也受到细菌的影响。   我们从父母那里遗传到了基因,但是当胎儿离开无菌的子宫,通过母亲的产道出生,就开始接触微生物的世界。婴儿学会爬行,便被巨大的、看不见的微生物云所包围。来自他人、食物、家具、衣服、汽车、建筑、树、宠物,甚至空气的微生物有上千亿甚至更多,其中绝大部分是细菌,也有病毒和真菌(包括各种酵母)。   微生物至少在地球上居住了25亿年,人类和它共同进化了很多年。“肠道菌群的研究并非一个新的课题,100多年前就有科学家提出菌群对人体健康很重要,但是一直因为研究手段有限而限制了其发展,主流医学界研究的人不多,进展也不大。”赵立平说。   在过去,要想认识一种细菌,先要将它分离出来,进行培养,再用显微镜鉴定。但肠道菌群有几千个,而且都是厌氧菌,一遇到有氧环境就迅速死掉,人们很难把它们逐一分离出来加以识别。并且有些肠道细菌是共生关系,根本无法单独培养,如今的技术也很难做到这一点。此外,肠道菌群本身的复杂也增加了人们认识它真面目的难度,这就像人的指纹和虹膜不可能完全相同一样,世上没有哪两个人的肠道菌群一模一样。   “肠道菌群研究领域随着生物医学进入基因时代而变得活跃起来。尤其是自2005年左右第二代基因测序技术出现以后,快速、一次性、大规模地解码DNA成为现实。科学家们可以扔下显微镜,从基因的层面了解肠道细菌。”   在这个领域,最早出现的是微生物和肥胖关系的研究。在赵立平眼里有一个很重要的标志性事件。2004年美国华盛顿大学的戈登教授领导的研究组在美国科学院院刊上发表一篇研究论文,指出肠道菌群可以调节动物的脂肪存储。“这是肠道菌群与肥胖研究的开山之作。”   实验使用了无菌动物。“无菌动物是通过无菌接生、在无菌环境里用无菌饲料来饲养的实验动物,身体里没有任何用已知手段能够检测出来的微生物。无菌小鼠的背景非常干净,能够很好地证实因果关系,检验某种疾病是否是由菌群引起。”第三军医大学基础部实验动物学教研室主任魏泓说,他所在

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