第10节-生理系统建模与仿真-（上）-上海生物信息技术研究中心.ppt

* 数学模型 建模方法 模型验证 * 生物体是具有多重结构的复杂系统，从亚细胞、细胞、组织、器官到生物整体，每一结构层次都是一个动态系统，而在每一结构水平上又可划分为若干个子系 统，如人体在整体水平上可分为多个功能系统，如循环系统、呼吸系统、体温调节系统等 。 * 动物实验 人体实验 生理系统建模仿真 包括多种建模仿真方法：物理仿真、模拟计算机仿真、数字计算机仿真 * 生理系统仿真适用建模方式 * SCIRun is an Open Source software project that is principally funded through the SCI Institutes NIH/NCRR CIBC Center. * * In SCIRun, a module is represented by a rectangular box on the Network Editor canvas. Data owing between modules is represented by pipes connecting the modules. A group of connected modules is called a Dataow Network, or net An innite number of nets can be created, each solving a separate problem. * 学生作业，使用SCIRun建立模型 * 心肌缺血模型，上一届同学的作业 图1：小狗心脏的有限元模型 图2：心肌缺血部位 图3：分层展示心肌缺血部分 机理建模过程 建立物理模型 建立数学模型 对模型进行检验和修正 系统辨识（实验建模法） 定义：在对输入和输出观测的基础上，在指定的一类系统中，确定一个与被识别系统等价的系统。 辨识方法：脉冲响应、最小二乘法、极大似然法 系统辨识的建模过程 辨识目的和先验知识 实验设计 模型类别确定 参数估计 模型验证 房室模型定义 房室：房室是包含某种物质的具有一定体积的空间，在任何时刻，这些物质都分布于房室中，但也可以在房室与房室之间以及房室与外界环境之间按一定的速度转移或转换，并满足物质守恒定律。 房室模型：由若干个房室组成的系统称为房室系统，描述这类系统中物质的运动模型(包括结构框图和运动方程式)称为房室模型。 房室模型的可辨识性 在实际的房室系统（特别是在生理、生态、环境等系统）中,实验条件是受到限制的。 此时，模型的参数能不能被估计出来（得到唯一的估计值），这就是模型结构的可辨识问题。 如果不具有可辨识性，就需要重新考虑模型结构。 生理仿真内容简介 神经元和神经网络 研究神经元的电活动、功能模型，以及据此组成的神经网络 神经网络的研究应用于数据挖掘、人工智能领域 血压调节系统 动脉系统模型、静脉系统模型、毛细血管模型 神经系统对血压的调节 生理仿真内容简介（续） 体温调节系统 中枢神经对体温的调控 体温控制系统的热交换模型 心脏电生理模型 心脏电生理模型 心脏状态仿真，如心肌缺血、心室肥大 生理仿真内容简介（续） 血液循环系统 系统包括体循环、肺循环、心脏 血液动力学研究 循环系统整体仿真 呼吸系统 系统生理功能（外呼吸、血液传输、内呼吸） 呼吸气体方程 肺力学分析 呼吸控制系统仿真 生理仿真内容简介（续） 激素与内分泌系统 血糖调节系统仿真 代谢模型 视听系统 眼球光学系统 大脑视区信息加工 视觉计算理论 听觉神经系统信息处理 生理仿真内容简介（续） 姿态与运动仿真 肌肉模型 关节力学分析 步行机器人数学模型 SCIRun SCIRun is a Problem Solving Environment (PSE), for modeling, simulation and visualization of scientific problems. SCIRun now includes the biomedical components formally released as BioPSE, as well as BioMesh3D. SCIRun is available for free and is open source. /cibc/software/106-scirun.html SCI Run SCIRun is developed and maintained by the NIH/NCRR Center for Integrative Biomedical Computing It runs on Unix, Mac, Linux The latest version is SCIRun 4.7, and the s