- 1、本文档共43页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
序列质量 附:Solexa 1.3以前的quality计算公式是: Quality计算: Q是用phred quality score的计算方式计算得到: p是对应的碱基call错的概率 计算得到的Q值是一个整数, 将这个Q值加上33或者64后再转换成ASCII字符 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS......................................... ..........................XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX.......... ...............................IIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIIII.......... .................................JJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJJ.......... LLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLLL........................................ !#$%()*+,-./0123456789:;=?@ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ[\]^_`abcdefghijklmnopqr | | | | | 33 59 64 73 104 0........................26...31.......40 -5....0........9.............................40 0........9.............................40 3.....9.............................40 0........................26...31........41 S - Sanger Phred+33, raw reads typically (0, 40) X - Solexa Solexa+64, raw reads typically (-5, 40) I - Illumina 1.3+ Phred+64, raw reads typically (0, 40) J - Illumina 1.5+ Phred+64, raw reads typically (3, 40) with 0=unused, 1=unused, 2=Read Segment Quality Control Indicator (bold) (Note: See discussion above). L - Illumina 1.8+ Phred+33, raw reads typically (0, 41) Q值对应ASCII码 454原始数据图片、SFF格式、FASTA格式(QUAL) HSAPGDX01D1KDA length=181 xy=1540_3788 region=1 run=R_2012_08_01_00_39_39 ACGTGTTCTGAGCCATATTGCGGTACTGGAAGGTGCGCCTGCACTGTCTGAGCACTGGTCACTGCTCGATACCAATGAAGCCTTATTTGATGAGGCGCGCACCACGCAGGCGGCGACTATTATCTTCTCGTTTGATCCAGAATAACCAAATCGAAAACGCTGGCAAGGCACACAGGGGATA HSAPGDX01D1KDA length=181 xy=1540_3788 region=1 run=R_2012_08_01_00_39_39 40 40 40 40 40 40 40 39 37 38 36 34 24 23 19 19 19 24 20 19 18 18 26 26 18 18 19 18 20 20 20 25 25 26 19 20 20 22 22 22 25 28 26 24 22 2
您可能关注的文档
- JIT_Production_Training_CN剖析.pptx
- jit的两种(推和拉)生产方式剖析.ppt
- JIT精益生产及实施改善剖析.ppt
- 心肺复苏(2015国培)讲解.ppt
- 数控编程- 刀具补偿指令及其编程方法讲解.ppt
- 心理健康课9 绿色上网 阳光心理 网络心理讲解.ppt
- 伴我成长的国产动画集剖析.ppt
- 心理学1181-第二章 注意讲解.ppt
- 弟子规总叙讲解.ppt
- JL48QT-3零部件检验基准书剖析.doc
- 第十一章 电流和电路专题特训二 实物图与电路图的互画 教学设计 2024-2025学年鲁科版物理九年级上册.docx
- 人教版七年级上册信息技术6.3加工音频素材 教学设计.docx
- 5.1自然地理环境的整体性 说课教案 (1).docx
- 4.1 夯实法治基础 教学设计-2023-2024学年统编版九年级道德与法治上册.docx
- 3.1 光的色彩 颜色 电子教案 2023-2024学年苏科版为了八年级上学期.docx
- 小学体育与健康 四年级下册健康教育 教案.docx
- 2024-2025学年初中数学九年级下册北京课改版(2024)教学设计合集.docx
- 2024-2025学年初中科学七年级下册浙教版(2024)教学设计合集.docx
- 2024-2025学年小学信息技术(信息科技)六年级下册浙摄影版(2013)教学设计合集.docx
- 2024-2025学年小学美术二年级下册人美版(常锐伦、欧京海)教学设计合集.docx
文档评论(0)