- 1、本文档共8页,可阅读全部内容。
- 2、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
拮抗菌与病原菌碳水化合物酶类比较分析.pdf
基因组学与应用生物学,2013年,第 32卷,第 1期,第 97—104页
GenomicsandAppliedBiology,2013,Vo1.32,No.1,97—104
数据分析
DataAnalysis
拮抗菌与病原菌碳水化合物酶类 比较分析
柳少燕 1陈捷胤-0 李蕾 1戴小枫
1中国农业科学院农产品加工研究所,北京,100193;2中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081
通讯作者,dxf@caas.net.cn
摘 要 拮抗菌通过分泌细胞壁降解酶降解病原菌细胞壁组分是其重要的拮抗方式。本研究以2个拮抗菌
(绿色木霉和枯草芽孢杆菌)和7个植物病原菌为研究对象,对碳水化合物酶类CAZymes(Carbohydrate.active
enzymes)进行了注释和比较分析,明确了拮抗菌相对于病原菌发生扩增的细胞壁降解酶亚家族;利用
ClustalX2.0多序列比对、Mega4.0构建系统发育树和MEME软件预测保守基序的方法,分析了扩增亚家族的
序列结构和进化特征。结果表明,拮抗菌中可能参与病原菌细胞壁降解酶类的亚家族CBM50、GH25和GH73
发生了显著扩增,并通过序列比较和进化分析初步明确了扩增的亚家族与拮抗菌特异降解病原菌细胞壁组分
之间存在关联,为拮抗菌细胞壁降解酶类亚家族CBM50、GH25和GH73参与拮抗的分子机理提供理论依据。
关键词 生物防治,拮抗菌,病原菌,细胞壁降解酶,基因家族扩增
ComparativeAnalysisoftheCarbohydrate—activeEnzymesbetweenAntag—
onisticM icroorganism andPlantPathogen
LiuShaoyan ChenJieyin1,2 LiLei DaiXiaofeng1,2
1InstituteofAgro—ProductsProcessingScienceandTechnology,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Bering,100193;2InstituteofCropSci—
ence,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing,100081
Correspondingauthor.dxf@caas.net.cn
DOI:1O.3969/gab.032.000097
Abstract Theimportantway ofantagonisticmechanism in antagonisticmicroorganismsisto degradethe
pathogencellwallbysecretedcell-wallrelatedenzymes.Inthisresearch,theCAZymesoftwoantagonisticmi—
croorganismsandsevenpathogenswerenanotatedwitl1CAZymesdatabase.andthen identifiedhteexpansion
CAZymessubfamiliesinantagonisticmicroorgna ismscomparedtopathogens.M oreover,thesequencescharacter-
isticnadphylogeneticofexpansionCAZymessubfamilieswereanalyzedbyClustalX 2.0.M ega4.0nadMEME
softwares.Theresultsshowedthatthecellwalldergadationsubfma iliesofCBM 50,GH25andGH73expnadedin
antagonisticmicroorganismscompraedtopathogens,andtheseexpnasionsubfma ilieswerecloserelativelytothe
specificdergadationofpathogencellwal1.ItissupposethattheCBM50,GH25nadGH73subfamiliesofantago-
nisticmicroorgna ismsplayallimportantroleintheantagonisticmechanism topathogens.
Keywords Biologicalcontrol,Antagonisticmicroorganism,Pathogen,Cellwalldergadation enzymes,Gene
fm
您可能关注的文档
最近下载
- 干部选拔任用制度问题调查问卷.doc
- 平台+模块、课证融通课程体系(源文件可编辑).pptx
- The Mummy: Tomb of the Dragon Emperor《木乃伊3(2008)》完整中英文对照剧本.docx VIP
- 新粤教版B版信息技术八年级下册全册同步课件.ppt
- 《采购风险管理》课件.pptx VIP
- 全国十省市2024年中考英语真题试卷含答案.docx
- 小学四年级下册数学期中测试卷及答案【网校专用】.docx
- 2023年副主任医师(副高)-职业病学(副高)历年考试真题试卷摘选答案.docx
- 2024行政执法考试试题与答案.pdf VIP
- 电导率仪仪器验证方案电导率仪仪器验证方案.pdf
文档评论(0)