微生物分类进展讲义.ppt

微生物的分类单位 微生物的命名 微生物的分类依据 微生物的分类方法 生物界的分类系统和微生物的常用分类系统 微生物的鉴定 型(form或type)：常指亚种以下的细分。当同种或同亚种不同菌株之间的性状差异，不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。（如不同血清型、噬菌型等） 菌株与型的区别： 菌株之间不存在鉴别性特征的差异，命名不同的菌株无需分类学依据，不同型的细菌之间存在鉴别性特征的差异，命名或鉴定不同的型必需有分类学依据。 属名重复出现，可缩写 如：E.coli （大肠杆菌）； S. pullorum（鸡白痢沙门氏菌） 只确定属名，未确定种名的某一株细菌 Salmonella sp. 只确定属名，未确定种名的若干菌株Salmonella spp. 亚种用subsp.（正体）表示 Pasteurella multocida subsp. septica 微生物分类方法 微生物分类方法 1.传统分类法（classical classification） 以细菌的形态和生理生化特征为依据。 微生物分类方法 2.数值分类法（numerical classification） 20世纪60年代兴起，细菌的各种生物学性状“等重要原则”分类，性状数量超过50个。 测定100个以上的各种形状，利用计算机进行菌株的相互比较，并得出总的相识值。一般认为同种微生物菌株之间的相似值≥80% 微生物分类方法 3.种系分类或自然分类(natural calssification) 以细菌大分子物质（核酸、蛋白质）结构的同源程度进行分类。 微生物分类方法 3.遗传学分类法 DNA分子杂交：比较不同微生物DNA碱基排列序列的相似性进行微生物的分类鉴定。 1987年国际系统细菌委员会规定，DNA相关性在70%以上，杂交分子的热解链温度相差小于5℃作为种的界限。 G+C mol%:同一个种类的不同菌株的G+C mol%差别应在4-5%以下；同属不同种的G+C mol%差别应在10-15%以下。 2. 核酸分子杂交法 遗传分类法 生物分类系统 微生物分类系统 伯杰氏手册: 是目前进行细菌分类、鉴定的最重要参考书，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。 微生物的鉴定步骤 分离纯化微生物 测定一系列必要的指标 查找权威性鉴定手册 微生物鉴定技术的不同水平： 根据微生物分类学中使用的技术和方法，可把它们分成四个不同的水平： ①细胞形态和行为水平； ②细胞组分水平； ③蛋白质水平； ④基因组水平。 微生物快速鉴定和自动分析化技术 1.微量生化系统检测 如商品化的API系统，Enterotube系统等鉴定系统 快速、自动化检微生物测仪器和设备：阻抗仪、生物发光测定仪、自动微生物检测仪等 * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * (Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology) 《伯杰氏鉴定细菌学手册》是细菌分类系统的综合和标准，由美国细菌学家协会（现称美国微生物学会）发起编写的，最初指定David H.Bergey作为编委会主席，在1923年出版了手册的第一版，相继在1925、1930、1934、1939、1948、1957、1994年出版了第二至第九版，成为国际上细菌学家普遍接受和采用。 伯杰氏手册——伯杰氏鉴定细菌学手册 第九版伯杰氏细菌鉴定手册设立35个群，将古细菌部改编为5个群，全书描写了约500个属。 划分为四大类： 第一类 具细胞壁的革兰氏阴性真细菌 第二类 具细胞壁的革兰氏阳性真细菌 第三类 无细胞壁的真细菌 第四类 古细菌 * * (Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology） 第一版1984-1989年陆续出版，共四卷 在着重于表观特征描述的基础上，结合化学分类、数值分类特别是DNA相关性分析，及16S rRNA寡核苷酸编目在生物种群间的亲缘关系研究中的应用作了详细的阐述，体现了细菌分类的研究从表观向系统发育体系的发展。除此，还附有每个菌群的生态、分离、保藏及鉴定的方法。 伯杰氏手册——伯杰氏系统细菌学手册 第二版 由George Garrity主编分为5卷，将从2000年起陆续出版。这一版纳入了研究核糖体RNA测序所