草菇TPI基因的克隆、结构及其在同核、异核菌株中的表达量.pdfVIP

福建农林大学学报 (自然科学版) 第42卷 第 1期 JournalofFujianAgricultureandForestryUniversity(NaturalScienceEdition) 2013年 1月 草菇 基因的克隆、结构及其在 同核、异核菌株中的表达量 刘朋虎 ，邓优锦 ，江玉姬’，谢宝贵 (1．福建农林大学茵物研究中心；2．福建农林大学国家茵草工程技术研究中心，福建 福州350002) 摘要：分别从不能出菇的草菇单孢菌株PYd21(基因组测序菌株)和PYdl5(重测序菌株)及由PYd21、PYdl5配对杂交获得 可正常出菇的异核菌株H15-21中克隆测序 了磷酸丙糖异构酶(TH)基因，并对 TPI基因的结构及其在3个菌株中的表达 量进行了分析．结果表明：PYd21、PYdl5中z 基因的序列完全相同；转录组读段定位、双末端分析结果显示 ，TPI基因全长 1015bp，开放阅读框序列全长756bp，编码251个氨基酸，有6个外显子、5个 内含子；RNA加工过程中存在两种可变剪切 类型和两个可变剪切位点；数字基因表达谱测序的结果表明，PYd21、PYdl5和H15-21中TPI基因的表达量(TPM)分别为 30．25、36．49、77．17，同时通过实时荧光定量PCR分析3个菌株中TPI基因的表达情况证实了该结果，表明草菇中TPI基因 的表达表现出异核体表达的协同增效作用，预示着异核菌株中两种不同细胞核存在相互作用． 关键词：草菇；磷酸丙糖异构酶；可变剪切；协同增效作用 中图分类号：$646．13 文献标识码 ：A 文章编号2013)01-0063-05 Cloningandstructuralanalysisoftriosephateisomerasegeneanditsexpression levelsinhomokaryonandheterokaryonofVolvariellavolvacea LIUPeng．hu ，DENGYou-jin ，JIANGYu-ji，XIEBao—gui (1．MycologicalResearchCenter；2．NationalEngineeringReseaechCenterofJuncaoTcehonology， FujianAgricultureandForestry、University，Fuzhou，Fujina350002，China) Abstract：A hybridheterekaryon，H15-21fruiting，W88abtainedbymating twosingle spore isolatesnon-fruiting ，PYd21and PYdl5．ThegenomesofPY21na dPYdl5 were sequencedby der／o~osequencing nadre—sequencingrespectively．Triosephate isomerase(TE1)geneswereclondenadsequencde frombothPYd21andPYdl5．Menawhiletheirstructureswereanalyzedbytrna— seriptional readsmappingandpaired—endnaalysis．Alignmentna alysisrevealedthatbothsequencesofTPIgenefrom bothisoaltes were identica1．TheTPIgenewasconsistedof1015bpwiht aIlopenreading frameof 756bpencoding apolypeptideof251amino acids ．TPIgenecontained6exonsnad5intmns．Twotypesofalternativesplicing andwtoalternativesplicing siteswere identified duringRNAprocessi