利用环形染色体构象捕获技术对Bcl11b座位在细胞核内空间组织的研究.pdfVIP

利用环形染色体构象捕获技术对Bcl11b座位在细胞核内空间组织的研究.pdf

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利用环形染色体构象捕获技术对Bcl11b座位在细胞核内空间组织的研究

中国细胞生物学学报 Chinese Journal of Cell Biology 2013, 35(11): 1584– 1591 DOI: 10.11844/cj cb.2013.11.0249 利用环形染色体构象捕获技术对Bcl11b基因 座位在细胞核内空间组织的研究 1 2 1 1 3 1* 任立成 李美英 孙元田 苏振宇 杨 智 李冬娜 1 2 ( 海南医学院生物学教研室, 海口571199; 中国热带农业科学院热带生物技术研究所, 海口571101; 3海南医学院形态学教研室, 海口571199) 摘要 环形染色体构象捕获(4C)技术实现了在全基因组范围内捕获与4C靶位点发生相互作 用的基因座位, 因而通过4C相关技术可以进一步研究靶基因座位在细胞核内的空间组织形式。该 文以Bcl11b基因座位作为4C分析的靶位点, 通过优化4C分析的反向巢式PCR扩增条件, 实现4C分 析PCR的高效扩增; 并通过有限克隆筛选与普通测序分析相结合的方法, 在全基因组范围内捕获 到一些与Bcl11b基因座位发生潜在相互作用的基因座位。这些基因座位与靶位点间的相互作用 既有发生在相同染色体内的, 也有发生在不同染色体之间的。这些基因座位间的相互作用表明了 Bcl11b基因座位在细胞核内复杂的空间组织形式。 关键词 环形染色体构象捕获技术; 染色体构象捕获技术; Bcl11b基因座位; 染色质空间组织 Study on the Spatial Organization of Bcl11b Gene Locus in Cell Nucleus with the Circular Chromosome Conformation Capture Techniques 1 2 1 1 3 1* Ren Licheng , Li Meiying , Sun Yuantian , Su Zhenyu , Yang Zhi , Li Dongna 1 2 ( Department of Biology, Hainan Medical University, Haikou 571199, China ; Institute of Tropical Bioscience and Biotechnology, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Haikou 571101, China ; 3Department of Morphology, Hainan Medical University, Haikou 571199, China) Abstract The genome-wide gene loci can be captured by the circular chromosome conformation capture (4C) technique, which potentially interacted with the target gene locus of the 4C assay. The spatial organization of the 4C target gene locus

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