功能基因筛选方法的研究进展.pdfVIP

维普资讯 国外医学药学分册 2003年 l2月 第 30卷 第 6期 综述与编译 功能基因筛选方法的研究进展 殷 红，杜冠华综述 (中国医学科学院／中国协和医科大学药物研究所 ，北京 100050) 摘要：功能基因的筛选研究可为深入 了解疾病 的发生和发展过程 ，药物作用机制，建立新的疾病诊 断、预防、治疗策略奠定基础 ，因而正在成为当今药物及药物靶点发现的重要途径。该领域的迅速 发展很大程度上借助于技术方法的不断提高和发展 。本文对功能基因筛选研究策略及主要技术方 法，如表达谱分析法、高通量细胞筛选技术、反义核酸技术、转基因／基因敲除技术等的研 究进展及 应用进行 了综述 。 关键词 ：功能基 因；筛选 ；研究方法 中图分类号：Q78 文献标识码 ：A 文章编号：1001-0971(2003)06-0321-06 近年来，随着人类基因组计划的初步完成，后基 病组织的表达谱差异分析 (expressionprofilingofnor— 因组时代蛋白质组学、功能基因组学等研究的深入 malanddiseasedtissues)获得疾病的相关基因，进一 开展给药物发现领域带来了革命。基因组庞大规模 步进行基因功能的筛选研究 (图 1)。该筛选策略与 序列的可利用性、高通量基因表达检测方法的发展 疾病过程密切相关，较多地应用于新药及治疗靶点 及大规模数据分析能力的提高，为药物发现展现了 的发现El～3l。 广阔的前景。然而，新基因不等于新药靶点或新药 物。目前，药物发现的主要挑战之一，就是要快速估 测和 了解新基因的生物学功能，确定该基因是否能 够成为药物靶点或直接作为治疗药物(基因药物或 片技术) 蛋 白质药物)，即进行功能基因的筛选研究。功能基 因的筛选研究正在成为当今药物及药物靶点发现的 重要途径，同时也为深入了解疾病的发生和发展过 谱 程、药物作用机制以及新的疾病诊断、预防、治疗策 l面 略的建立奠定了基础 。这一领域的迅速发展很大程 塑 兰 l发用抗 I J原多肽l 度上借助于众多技术方法的发展和应用 ，本文对其 I数据库注释， ． ． ． ． ． ． ． ． ． ． ． ． ． ． ． ． ． ． ． ．__J l生物信息分析， 中一些主要方法及其研究进展进行了综述。 I功能基因组实验 1 功能基因筛选的基本策略 目前，国内外进行功能基因筛选研究的基本策 可开发的酶活性 略包括：(1)通过表达谱差异分析、生物信息学分析 和基因克隆等途径获得候选基因；(2)对候选基因进 囤 圉 行功能评价(identificationoffunction，可在基因组、转 录、蛋白质组和代谢产物等水平进行)；(3)基因功能 图1 表达谱差异分析筛选功能基因研究的框架图 确证(validationoffunction)；(4)决定开发战略。 1．1 差异表达筛选功能基因 1．2 生物信息学分析确定候选功能基因 获得候选基因的研究路线之一是通过正常和疾 获得候选基因的另一研究路线是通过生物信息 学分析 (bioinformaticanalysis)预测、选定基因序列、 收稿 日期 ：2oo2—1