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考试范围及题型
考试范围包括所讲过的内容
考试题有选择题(单选)、是非题和问答题,其中选择题和是非题有50%左右以英语出题
课程复习:原核生物与真核生物两大体系
1. 原核基因组与真核基因组(prokaryotic genomes and eukaryotic genomes)
1.1. 大小(size):基因组大小(genome size)一般以单倍体基因组的核酸量来衡量,单位有pg、Dalton、bp 或 kb 、Mb等.1 pg = 6.02 x 1011 Daltons = 9.8 x 108 bp. 原核生物的genome size一般都比较小,且变化范围也不大(最大/最小约为20)。由于原核生物基因组中的非基因DNA(non-genic DNA)的含量较少,因此它们的基因组大小与其所含的基因数目是相对应的.真核生物的genome size一般要比原核生物的大很多,且变化范围也很大(最大/最小可达8万)
1.2. 基因结构(gene structure: continuous coding sequences, split genes)类核基因组--环状,较小;通常由单拷贝或低拷贝(low-copy)的DNA序列组成;基因排列紧密,较少非编码序列(streamlined)核基因组--多线状;大小一般要比类核基因组大好几个数量级,且变化范围很大;有大量的非编码序列(重复序列、内含子等)
1.3. 非编码序列(non-coding sequences: repeated sequences, introns)局部分布的重复序列(串联式的高度重复序列)散布的重复序列(SINES, LINES)内含子(intron)I 类II 类III 类核mRNA内含子(nuclear mRNA intron)即剪接体内含子(spliceosomal intron)核tRNA内含子(nuclear tRNA intron)古细菌内含子(archaebacterial intron)
1.4. 细胞器基因组(organelle genomes: mitochondrial genomes, chloroplast genomes)
线粒体基因组--在不同类型的生物(多细胞动物、高等植物、原生动物、藻类、真菌)中变化很大多细胞动物:细小、致密,没有或很少非编码序列高等植物:复杂、不均一,比动物的大得多原生动物、藻类、真菌:或偏向于动物型,或偏向于植物型,但又有其各自的独特之处
叶绿体基因组--比较均一,85 ~ 292 kb(大部分都在120 ~ 160 kb之内);特例:伞藻属(Acetabularia),2000 kb
2. 转录(transcription)
2.1. RNA聚合酶(RNA polymerase)
原核生物:1种,全酶(holoenzyme)由核心酶(2α, β, β’)与σ亚基组成,σ亚基的作用是a)降低酶与非特异DNA的亲和力; b)提升酶与启动子的亲和力。
真核生物:3种,由两个较大的亚基和多个较小的亚基组成
Polymerase I: large rRNA precursor, 位于核仁
Polymerase II: mRNA precursors, snRNAs, 位于核质。核心亚基(core subunits)
Rpb1, Rpb2, Rpb3,对聚合酶的活性必不可少,分别与原核RNA聚合酶的β’, β和α亚基同源,且功能也基本相同.
Polymerase III: tRNA precursors, 5S rRNA precursor, U6, etc. 位于核质
2.2. 顺式作用元件与反式作用因子(cis-acting elements and trans-acting factors)
2.2.1. 顺式作用元件
启动子(promoters)
聚合酶的结合位点(binding site),一般位于转录起始位点上游。
RNA聚合酶与启动子的结合,并且从Closed promoter complex?Open promoter complex,转录才能开始.
结构:
原核启动子:Consensus sequency: -10 box (Pribnow box),负责解链; -35 box),用于识别。
真核启动子:I类, II类,III类
增强子:较多在真核生物中存在
转录因子(transcription factors)为反式作用因子,真核基因的转录需反式作用因子
通用转录因子: I类, II类,III类
基因特异转录因子(激活子)
2.3. 多顺反子转录与单顺反子转录
原核生物的转录方式:操纵子(operons)介导的多顺反子转录
操纵子--一组相邻的协同控制的基因。
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