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农推-林业生物技术-基因工程
第二章
林木基因工程
本章要点
2.1 基因工程的基本知识
2.2 植物基因的分离克隆
2.3 植物遗传转化
2.4 基因工程与林木遗传改良
2.1 基因工程的基本知识
基因工程
遗传工程,重组DNA技术(DNA recombination)
是指采用分子生物学手段,将不同来源的基因,按照人类的愿望,在体外进行重组,然后将重组的基因导入受体细胞,使原有生物产生新的遗传特性,获得新品种,生产新产品的技术科学。
可以跨越天然物种屏障,把来自任何一种生物的基因导入到新的生物中,实现不同生物的基因重组或基因转移,达到对某种生物个别性状遗传改良的目的。
是现代生物技术的核心和支柱。
基因组
某种生物体或一个细胞所携带的全部DNA序列的总和。
狭义的基因组(genome)是专指核基因组。
广义的基因组还包括叶绿体基因组和线粒体基因组。
核基因组
是指维持生物体完整生命功能所必须的1组染色体或配子体(性细胞)所包含的全部DNA序列(nDNA)。
一个生物物种单倍体基因组的DNA含量称为该物种的C值,每一个生物物种的C值是恒定的,一般用pg或碱基对表示。1pg=10-12g,相当于31cm长的DNA排列,约109bp。
叶绿体基因组
叶绿体是植物进行光合作用的场所,
叶绿体中含有独立于核基因组以外的叶绿体基因组,称为cpDNA。
一个植物叶片细胞通常含有数百个叶绿体,
一个叶绿体中含20-80个cpDNA拷贝。
银杏的叶绿体基因组为158kb。
线粒体基因组
线粒体是动植物细胞将有机物质氧化降解成水和二氧化碳、并释放出能量的细胞器。
也含有独立于核基因组以外的基因组,称为线粒体基因组,其DNA称为线粒体基因组DNA(mtDNA)。
植物的线粒体基因组比动物要大得多。
植物线粒体基因组含有数目不等的内含子序列。
基因
指编码功能蛋白质或RNA分子所必须的DNA序列或RNA序列,是遗传的功能单位,可产生或影响某种表型。
一般又可分为
结构基因 (structure gene):编码蛋白质(或RNA)
调控基因 (control gene):调控结构基因的表达。
通常指结构基因。
真核基因的结构
2.2 目的基因的克隆
2.2.1 基因克隆的工具酶
2.2.2 基因克隆的载体
2.2.3 基因克隆的方法
2.2.1基因克隆的工具酶
限制性内切核酸酶 restriction endonuclease
DNA连接酶 DNA ligase
DNA聚合酶 DNA polymerase
反转录酶
碱性磷酸酶
S1核酸酶
末端脱氧核苷酸转移酶
2.2.1.1 限制性内切核酸酶
限制作用:一定类型的细菌可以通过限制性酶的作用,破坏入侵的外源DNA(如噬菌体DNA),使得外源DNA对生物细胞的入侵受到限制。
修饰作用:生物细胞自身的DNA分子通过修饰酶的作用,在碱基中特定的位置发生了甲基化,而得到修饰,可免遭自身限制性酶的破坏。
2.2.1.1 限制性内切核酸酶
主要有 I 型、Ⅱ型、Ⅲ型。
Ⅱ型运用最广泛,I型和Ⅲ型应用极少。
I型目前发现的只有EcoB和EcoK两种,
Ⅲ型目前已知的主要是EcoPI和EcoP15。
(1)Ⅱ型限制性内切核酸酶的特点
①能够识别特异性的DNA识别位点,这种识别位点通常具有双链回文对称的结构;
②切割后形成的双链DNA分子能够彼此互补,并能够重新连接;
③切割和修饰功能由两种不同的酶催化完成;
④切割不需要ATP和SAM(硫腺苷甲硫苷酸)作为活性催化因子。
(2)命名和分类
①利用属名的第1个字母和种名的前2个字母代表内切酶的来源。例如,来自大肠杆菌(Escherichia coli)的内切酶用Eco来命名,来自流感嗜血菌(Haemophilus influenzae)的用Hin表示。
②第4个字母表示酶来源的菌株和菌型。例如,EcoRI中的R表示该酶来自大肠杆菌的R菌株。
③在同一菌株分离获得的不同内切酶按照分离时间的先后,以罗马数字加以标注,如HindI、HindⅡ、HindⅢ。
(3)影响因素
①DNA的浓度和质量----最关键的因素。
②酶切消化的缓冲液。
③酶切反应的温度。
④其它因素。
(4)应用
①构建重组的DNA分子。
②探针准备。
③DNA物理图谱构建。
④DNA甲基化分析。
2.2.1.2 DNA聚合酶
作用:
将脱氧核糖核酸连续地连接到双链DNA分子的3′-OH末端,催化核苷酸的聚合作用,形成长链的核酸分子。
(1) 大肠杆菌DNA聚合酶I、Klenow酶
大肠杆菌DNA聚合酶 I 的作用:
①DNA缺口平移,制备DNA探针。
②用于DNA序列分析。
Klenow酶的主要用途:
①DNA放射性标记。
②合成cDNA的第2链。
③补平内切酶切割双链DNA分子形成的粘性末端。
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