分子生物学-张晓东-3生物软件概述.pptVIP

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分子生物学常用 软件概述 生命科学领域流程图 推荐网址 /chinese/ / 通常研究阶段 资料整理阶段 Reference Manager 9.5 在线查找PubMed和609个Z39.50数据库的专业资料,保存为本地文件; 与word整合,直接在word中查找资料,插入引用,并对参考文献进行相应杂志引用格式要求的格式化; 强大的资料管理功能; 序列分析、实验设计模拟阶段 Vector NTI Suite 7.1 Vector NTI Suite 7.1 特有良好的数据库管理系统; 大部分分析可在数据库中进行 选定(数据)-分析-结果(显示、保存和入库) 对核酸蛋白酶分子进行限制酶分析、结构域查找等多种分析操作; 生成重组分子策略和实验方法、进行限制酶片段的虚拟电泳; 输入各种格式的分子数据、加以注释、输出高质量的图像 功能简介 3DMol-显示PDB格式分子三维结构 AlignX-序列相似性比较 Align Xblocks-序列局部完全相同比较 BioPlot-几十种核酸蛋白序列分析、理化分析 ContigExpress-将小片段拼装成长序列 GCGConverter-GCG格式文件转换成NTI格式 PubMed/Entrez Search-搜索PubMed、PDB、GenBank Back Translation-核酸反向翻译工具 Matrix Editor-矩阵数据编辑 DNAsis DNAsis 限制性内切酶分析 DNAsis 质粒作图 DNAsis 翻译分析 DNAsis 引物设计 DNAsis RNA二级结构预测 DNAsis DNA测序策略构建 DNAsis 多序列比较以及进化树分析 DNAsis 蛋白2D结构预测 Primer Premier 5.0 Primer Premier 5.0自动搜索引物 Primer Premier 5.0强大功能 GeneDoc 3.23 亮丽的序列对比 Gene Construction kit 2.5 最好的克隆策略与质粒作图软件 本阶段的其他相关软件 各种软件不同数据格式转换软件-Seqverter 1.3 三维结构显示-RasMol 2.7 RNA二级结构分析-RNAdraw 实验操作和数据分析阶段 BandScan 4.5 分析流程 BandScan 4.5 统计分析 SAS (Statistical Analysis System) SigmaPlot 2000 Excel Motic Fluoscense-显微照片分析软件 多种图象分析功能 通常的流式细胞仪周期分析系统 显微镜系统细胞周期分析系统 依据显微镜照片对视野的细胞数进行计数(Quantifying cell mono-layer cultures by video imaging) 原位荧光分析进行单细胞DNA定量(To test the feasibility of in situ DNA quantitation of adherent cells nuclei by fluorescence imaging) 处理获得的数据,对细胞进行细胞周期分析 -Computer-assisted Detection of Apoptosis Anal Quant Cytol Histol. 1999 Dec;21(6):489-97. Related Articles, Links DNA content by in situ fluorescence imaging and S-phase detection, with chromatin structure preserved. Chassoux D, Franchi J, Cao TT, Debey P. Institut National de la Recherche Agronomique Unite 806/Equipe Associee 2703 Museum National dHistoire Naturelle, Paris, France. chassoux@ibpc.fr 文章写作和结果发表 常用软件 文献引用-Reference Manager 9.5 生成出版质量的图片-Pov-Ray for windows 3.1 序列递交-sequin 3.32 O V S X X/S O+A V+A S+A X+A X/S+A * * GENOMICS PROTEOMICS CELLULAR ANALYSIS Functional genomics System pathways Precision design …for life 资料收集整理 序列分析、实验设计模拟阶段 实验操

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