原创力文档VPA an R tool for analyzing sequencing variants with user-specified frequency pattern 英文论文文献.docVIP
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- 2017-05-08 发布于上海
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VPA an R tool for analyzing sequencing variants with user-specified frequency pattern 英文论文文献
Huetal.BMCResearchNotes2012,5:31
/1756-0500/5/31
TECHNICAL NOTE
OpenAccess
VPA:anRtoolforanalyzingsequencingvariants
withuser-specifiedfrequencypattern
QiangHu1,DanWang1,LiYan1,HuaZhao2andSongLiu1*
Abstract
Background:Themassiveamountsofgeneticvariantgeneratedbythenextgenerationsequencingsystems
demandthedevelopmentofeffectivecomputationaltoolsforvariantprioritization.
Findings:VPA(VariantPatternAnalyzer)isanRtoolforprioritizingvariantswithspecifiedfrequencypatternfrom
multiplestudysubjectsinnext-generationsequencingstudy.Thetoolstartsfromindividualfilesofvariantand
sequencecallsandextractv
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