家畜育种学07种畜的遗传评估(三)：BLUP育种.pptVIP

/jcyzx/index.htm 分子亲缘矩阵逆矩阵的计算 令 为 对角线元素组成的对角阵，让 按以下规则加入已知父母的个体的有关元素构建 如果双亲已知为 和 ： 如果个体父或母已知 为： 要加入的数值 中的位置 要加入的数值 中的位置 /jcyzx/index.htm 如果是一个非近交群体，则可直接构建 如果双亲已知为 和 ： 如果个体父或母已知为 ： 要加入的数值 中的位置 2 -1 0.5 要加入的数值 中的位置 3/4 -2/3 1/3 /jcyzx/index.htm 第四节 育种值估计模型 动物模型 （animal model ） 数学方程式： 期望和方差： 混合模型方程组： /jcyzx/index.htm 公畜模型 （sire model ） 数学方程式： 期望和方差： 混合模型方程组： 是公畜间加性遗传相关矩阵 /jcyzx/index.htm 假设和约束条件： 只可用来估计公畜的育种值 公畜在群体中与母畜的交配是完全随机的 母亲之间没有血源关系 每个母亲只有一个后代，即一个公畜的所有后代都是父系半同胞。 /jcyzx/index.htm 公畜—母畜模型 （sire-dam model ） 数学方程式： 期望和方差： 混合模型方程组： 是公畜间加性遗传相关矩阵 是母畜间加性遗传相关矩阵 /jcyzx/index.htm 假设和约束条件： 只适用于后裔测定的父、母亲育种值预测，而且主要适用于猪、鸡等母畜繁殖力高的畜禽 动物只有一个记录 有记录的动物不是其它动物的双亲 双亲无记录 /jcyzx/index.htm 外祖父模型 （maternal grandsire model ） 数学方程式： 期望和方差： 混合模型方程组： 是公畜间加性遗传相关矩阵 是外祖父间加性遗传相关矩阵 /jcyzx/index.htm 假设和约束条件： 主要适用于种公牛评定 动物只有一个记录 有记录的动物不是其它动物的双亲 双亲无记录 每个母畜只有一个后代 ，且外祖母只有一个女儿 母畜在外祖父所有女儿中随机抽样 ， /jcyzx/index.htm 第五节 多性状BLUP 法的基本原理 BLUP原理同样可使用于对多个性状进行育种值估计。 当我们要对个体在多个性状上的育种值进行估计时，一种方法可以分别对每一性状单独进行估计，然后根据性状之间的经济重要性进行综合。 另一种方法可以利用一个多性状模型对多个性状同时进行估计。由于同时进行估计时考虑了性状间的相关，利用了更多的信息，同时可校正由于对某些性状进行了选择而产生的偏差，因而可提高估计的准确度。 /jcyzx/index.htm 两性状线性模型 合并的矩阵形式： /jcyzx/index.htm 令 两性状混合模型方程组的简化形式: 获得综合育种值 得到各个个体两个性状的估计育种值后，可用性状经济重要性进行加权计算综合育种值，或者将估计育种值转化为标准化的估计育种值，然后再加权计算综合育种值。即： /jcyzx/index.htm 第六节 BLUP育种值估计举例 单性状动物模型BLUP育种值估计 某种猪场有如下种猪性能测定资料，测定性状为达100 kg日龄，已知该性状的遗传力为0.33，试对该性状资料进行个体育种值估计。 种猪达100kg日龄记录 猪场 个体 父亲 母亲 达100kg日龄 1 1 — — 140 1 2 — — 152 1 3 1 — 135 2 4 1 2 143 2 5 3 2 160 /jcyzx/index.htm 个体间加性遗传相关矩阵的计算 个体间加性遗传相关矩阵逆矩阵的计算 构建 ： /jcyzx/index.htm 个体间加性遗传相关矩阵逆矩阵的计算 构建对角矩阵： 令： /jcyzx/index.htm /jcyzx/index.htm 构建线性模型 根据资料性质，可对种猪达100kg日龄写出如下动物模型： 用矩阵形式表示，则对于该资料有： /jcyzx/index.htm 构建混合模型方程组 因此有： 求解混合模型方程组有： /jcyzx/index.htm /jcyzx/index.htm 两性状动物模型BLUP法育种值估计 某种猪场有如下种猪性能测定资料，测定性状为达100 kg日龄和达100kg背膘 ，试以两个性状资料进行个体育种值估计。 种猪达100kg日龄和达100kg背膘厚测定记录 猪场 个体 父亲 母亲 达100kg日龄(d) 达100kg背膘厚（mm） 1