Discovery of a Novel Polyomavirus in Acute Diarrheal Samples from Children 英文参考文献.docVIP

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2017-05-11 发布于上海
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Discovery of a Novel Polyomavirus in Acute Diarrheal Samples from Children 英文参考文献

DiscoveryofaNovelPolyomavirusinAcuteDiarrheal SamplesfromChildren GuixiaYu1,2.,AlexanderL.Greninger3.,PavelIsa4,TungG.Phan5,MiguelAngelMart?′nez4,Mariadela LuzSanchez6,JuanFranciscoContreras7,Jose′IgnacioSantos-Preciado8,JulieParsonnet6,SteveMiller1,2, JosephL.DeRisi3,EricDelwart5,CarlosF.Arias4,CharlesY.Chiu1,2* 1Department of Laboratory Medicine, University of California San Francisco, San Francisco, California, United States of America, 2UCSF-Abbott Viral Diagnostics and DiscoveryCenter,SanFrancisco,California,UnitedStatesofAmerica,3DepartmentofBiochemistryandBiophysics,UniversityofCaliforniaSanFrancisco,SanFrancisco, California,UnitedStatesofAmerica,4DepartamentodeGene′ticadelDesarrolloyFisiolog?′aMolecular,InstitutodeBiotecnolog?′a,UniversidadNacionalAuto′nomade Me′xico, Cuernavaca, Morelos, Me′xico, 5Blood Systems Research Institute, San Francisco, California, United States of America, 6Division of Infectious Diseases and Geographic Medicine, Department of Medicine, Stanford University, Stanford, California, United States of America, 7Departamento de Microbiolog?′a e Inmunolog?′a, UniversidadAuto′nomadeNuevoLeo′n,Monterrey,NuevoLeo′n,Me′xico,8UnidaddeMedicinaExperimental,FacultaddeMedicina,UniversidadNacionalAuto′nomade Me′xico,Me′xico,DF,Me′xico Abstract Polyomaviruses aresmall circular DNA viruses associated with chronic infections and tumors in both human and animal hosts.Usinganunbiaseddeepsequencingapproach,weidentifiedanovel,highlydivergentpolyomavirus,provisionally namedMXpolyomavirus(MXPyV),instoolsamplesfromchildren.The,5.0kBviralgenomeexhibitslittleoverallhomology (,46%aminoacid identity)toknownpolyomaviruses,and,duetophylogeneticvariationamongitsindividualproteins, cannotbeplacedinanyexistingtaxonomicgroup.PCR-basedscreeningdetectedMXPyVin28of834(3.4%)fecalsamples collectedfromCalifornia,Mexico,andChile,and1of136(0.74%)ofrespiratorysamplesfromMexico,butnotinbloodor urinesamplesfromimmunocompromisedpatients.ByquantitativePCR,themeasuredtitersofMXP