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基于蚁群算法的单克隆菌落挑选仪路径规划.pdf

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基于蚁群算法的单克隆菌落挑选仪路径规划.pdf

学兔兔 第37卷 第3期 光 学 仪 器 Vo1.37,No.3 2015年 6月 OPTICAL INSTRUMENTS June,2015 文章编号:1005—5630(2015)03—0264—04 基于蚁群算法的单克隆菌落挑选仪路径规划 邱 实,程金光 ,张荣福 (上海理工大学 光电信息与计算机工程学院,上海 200093) 摘要:单克隆茵落挑选仪是集光学成像、图像识别和 自动控制等技术于一身,应用于生物工程领 域的一种高端仪器。对 12×8阵列挑选针和无序排列的茵落 目标,只有对挑选路径和顺序进行 优化,才能有效提高挑选通量。针对这一需求,利用蚁群算法的基本原理,对单克隆茵落挑选仪 挑选路径进行了优化。仿真实验结果表明,该算法可以有效提高挑选效率。 关键词:蚁群算法;信息素策略;能见度 中图分类号:TP391.4 文献标志码 :A doi:10.3969/j.issn.1005—5630.2015.03.016 Thepath0ptimization ofhigh—throughputmonoclonalcolony selection instrumentbasedonantcolonyalgorithm QrUShi,CHENGJinguang,ZHANGRongfu (SchoolofOptical—ElectricalandComputerEngineering,UniversityofShanghaifor ScienceandTechnology,Shanghai200093,China) Abstract:Thehigh—throughputmonoclonalcolonyselectioninstrumentisahigh—endequipment appliedtobiologicaleellengineeringwhichcontainsthetechnologiesofopticalimaging,image recognitionandautomaticcontro1.Forthe12×8probearrayandthetargetsinrandom order, onlytheoptimizationofselectedpathandordercanimprovethethroughput.Thus,thispaper presentstheprincipleofthebasicantcolonyalgorithm andoptimizestheselectionpathbased on thealgorithm.Thenresultsoftheexperimentprovethemethodcangreatly improvethe selectionefficiency. Keywords:antcolonyalgorithm ;pheromoneupdatestrategy;visiability 引 言 单克隆菌落挑选仪是集光学成像、图像识别和 自动控制等技术于一身,应用于生物工程领域的一种 高端仪器,在我国处于起步研制阶段。在经过诱变和培养的数以万计的菌株中,仅有百分之几是符合要 求的高性能菌株。传统的挑选菌株方式是通过 目视菌落形态颜色等特征,人工方式取出优质菌株,该方 法不仅重复性差,而且效率极低。为了提高挑选效率和可靠性,美国、德国、瑞士等国相继开发出基于光 学成像和图

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