第3章 核酸的化学ppt.ppt

一、核酸的一级结构 第2节 核酸的结构 一个核苷酸分子C3’-OH 与另一核苷酸分子的5’-磷酸基团脱水缩合形成的磷酸二酯键称为3′,5′-磷酸二酯键 核酸分子中的核苷酸序列或碱基序列称核酸的一级结构 5’ 5’ 3’ 3’ + * 主键为3ˊ, 5ˊ-磷酸二酯键 主链为重复的结构单元（磷酸—戊糖） 侧链为特征结构—碱基 具有严格的方向性：5ˊ→3ˊ 多核苷酸链结构特点 多核苷酸链是五十个以上的核苷酸分子通过3′,5′-磷酸二酯键相连而成的链状聚合物。 戊糖C5′上有完整磷酸基的一端称为5′-磷酸末端（5′-端）。戊糖C3′上连有羟基的一端，称为3′-羟基末端（3′-端） * 多核苷酸链书写方式 * 二、DNA分子的空间结构 研究背景 Chargaff规则：A＝T G＝C。 Franklin和Wilkins用X-射线衍射技术分析DNA结晶，取得了DNA分子为螺旋结构的直接证据。 1953年， Watson和Crick在前人研究成果的基础上，建立了DNA分子二级结构的双螺旋结构模型。 * （一）DNA分子的二级结构 James Watson (23y) Francis Crick (35y) * DNA分子由两条反向平行的多核苷酸链以右手螺旋方式围绕一假想的中心轴形成双螺旋结构。碱基位于螺旋内部，碱基平面与中心轴垂直；脱氧核糖和磷酸基团形成螺旋的骨架，位于螺旋的外侧。 两条链上位于同一平面的碱基按照互补规律缔合形成碱基对，G与C配对形成三个氢键，A与T配对形成两个氢键。 螺旋的每一周包含10个碱基对，相邻碱基对的距离为0.34nm，螺距为3.4nm。螺旋直径为2nm。 双螺旋结构的维系力包括：①氢键：维系双螺旋结构横向稳定； ②碱基堆积力：碱基之间层层紧密堆积，形成疏水型核心，保持双螺旋结构纵向稳定。③离子键：磷酸残基阴离子与介质中的阳离子形成离子键，可降低双链间的静电排斥力。 双螺旋结构要点 * 5′ 3′ 5′ 3′ 5′ 3′ 5′ 3′ 磷酸 核糖 碱基 T-A碱基对 C-G碱基对 * 双螺旋中的大沟对于DNA和蛋白质结合时的相互识别很重要 ，在沟内可以辨认碱基的顺序。 模拟DNA双螺旋（蓝色） 大沟中结合着肽 （红色） * DNA双螺旋的类型 ① A-DNA螺旋：DNA在75%相对湿度的钠盐中的构型。 ② B-DNA螺旋：DNA在92%相对湿度的钠盐中的构型。标准的右手双螺旋，细胞正常状态下DNA存在的构型。 ③ Z-DNA螺旋：左手螺旋，这种螺旋可能在基因表达的调控中起作用。 类 型 旋转 方向 螺旋直径（nm） 螺距（nm） 每转碱基对数目 碱基对间垂直距离（nm） 碱基对与水平面倾角 A－DNA B－DNA Z－DNA 右 右 左 2.0 2.3 1.8 2.8 3.4 4.5 11 10 12 0.255 0.34 0.27 20o 0o 7o * （二）DNA分子的高级结构 超螺旋结构 * 核小体、染色质和染色体 * 真核生物染色体DNA组装不同层次的结构 DNA （2nm） 核小体链（ 11nm，每个核小体200bp） 纤丝（ 30nm，每圈6个核小体） 突环（ 150nm，每个突环大约75000bp） 玫瑰花结（ 300nm ，6个突环） 螺旋圈（ 700nm，每圈30个玫瑰花） 染色体（ 1400nm， 每个染色体含10个玫瑰花200bp） * 三、RNA分子的结构与功能 ① 单链结构，碱基组成为A、G、C、U等，稀有碱基或修饰碱基较多，稳定性较差，易水解。 ② 单链自身回折，碱基互补（A＝U，G≡C）形成局部双螺旋，非互补区形成突环，称“茎环”结构或发夹结构。 ③ RNA同样要形成高级结构时才能发挥活性。 参与蛋白质合成的RNA 核糖体RNA rRNA（ribosome RNA） 信使RNA mRNA（messenger RNA） 转运RNA tRNA（transfer RNA） RNA的结构特点： * （一）mRNA mRNA的功能是将细胞核中基因信息转录后携带出来，作为指导蛋白质生物合成的直接模板。 真核细胞生物的mRNA是由其前体核不均一RNA（hnRNA）剪接而成。 真核细胞成熟mRNA的结构特点： （1）5ˊ端帽子结构：5ˊ-末端在成熟过程中会加上7-甲基鸟嘌呤核苷三磷酸（m7Gppp），称为“帽子”结构。该结构与mRNA的稳定性有关，并与其转运出细胞核、与核糖体结合以及与蛋白质生物合成的起始等过程都有一定的关系。（2）3ˊ端多聚腺苷酸尾部：3ˊ-末端有一段20～200个腺苷酸的多聚腺苷酸尾部（poly A），与mRNA的稳定性和转运出细胞核的过程等有关。 * （二）tRNA