高通量虚拟筛选(HTS)与药物先导物的发现.ppt

高通量虚拟筛选与药物先导物的发现 主要内容 高通量虚拟筛选策略与方法 分子识别：大部分药物通过与特定的酶或受体等 靶标结合而起作用，这种结合就叫做分子识别 最通常的例子是酶与底物、激素与受体、配体与受体以及抗原与抗体等之间的结合 配体与受体的识别理论是虚拟筛选，甚至整个药物设计方法的基础 高通量虚拟筛选策略与方法 高通量虚拟筛选策略与方法 高通量虚拟筛选应用实例 雌 激 素 受 体 激 动 剂 和 拮 抗 剂 虚拟筛选的进一步验证 用虚拟筛选最后得到的化合物与人的雌激素受体进行结合活性测定 实例一 高通量虚拟筛选应用实例 雌 激 素 受 体 激 动 剂 和 拮 抗 剂 测试结果说明: 虚拟筛选可以从各种各样的结构中找到潜在 的激动剂和抑制剂 实例一 高通量虚拟筛选应用实例 蛋白络氨酸磷酸酯酶抑制剂 实例二 背景 PTB-1B是发现糖尿病药物的重要靶标 PTB-1B能够催化水解胰岛素受体中的磷酸化 络氨酸，使得胰岛素受体失活，Ⅱ型糖尿病的发 作涉及到PTB-1B的过量表达 PTB-1B有两个结合位点： 具有催化活性的位点 没有催化活性的位点 高通量虚拟筛选应用实例 蛋白络氨酸磷酸酯酶抑制剂 实例二 部分 利用单浓度测试对40万个化合物进行分析 对PTB-1B的抑制活性达到300μmol/l 则认为值得进行进一步的而研究 第一部分： 实验筛选 第二部分：虚拟筛选 利用分子对接对2.3万化合物进行虚拟筛选 对PTB-1B的抑制活性达到200μmol/l， 则认为值得进行进一步的而研究 高通量虚拟筛选应用实例 蛋白络氨酸磷酸酯酶抑制剂 实例二 部分 第三部分： 抑制活性测试——IC50 测试， 一个化合物的IC50 低于100μmol/l， 则认为它“命中目标” 高通量虚拟筛选应用实例 蛋白络氨酸磷酸酯酶抑制剂 实例二 部分 高通量虚拟筛选应用实例 蛋白络氨酸磷酸酯酶抑制剂 实例二 部分 第四部分： 比较高通量筛选和分子对接 对两批活性化合物进行多样性和类药性分析 高通量虚拟筛选应用实例 蛋白络氨酸磷酸酯酶抑制剂 实例二 部分 第一部分： 实验筛选——单浓度测试 第二部分：虚拟筛选 抑制活性测试——IC50 测试 第三部分： 第四部分：比较高通量筛选和分子对接 高通量虚拟筛选应用实例 蛋白络氨酸磷酸酯酶抑制剂 实例二 实验筛选 在40万个化合物中，有543个化合物 在300μmol/l浓度能够明显抑制PTB-1B 单浓度测试 抑制活性测试 单浓度测试中的543个化合物中85个化合物的 IC50介于100μmol/l～1μmol/l之间， 命中率为0.021% 高通量虚拟筛选应用实例 蛋白络氨酸磷酸酯酶抑制剂 实例二 虚拟筛选 主要考虑要点： 分子是否同时与晶体结构中的两个位点作用， 同时与两个位点作用，将有助于提高其活性 分子中是否有羧基 在选定365个化合物中，178个同时与两个位点作用 187个化合物只于一个位点作用 ——889个分子进行分析 高通量虚拟筛选应用实例 蛋白络氨酸磷酸酯酶抑制剂 实例二 虚拟筛选 ——抑制活性测试 在365个化合物中，127个IC50值低于100μmol/l 命中率达34.8%， 21种化合物的IC50达到10μmol/l 最好的化合物的IC50为1.7μmol/l 高通量虚拟筛选应用实例 蛋白络氨酸磷酸酯酶抑制剂 实例二 实验筛选与虚拟筛选的比较 分子对接的命中率是高通量筛选的1700倍 比较——说明分子对接能够淘汰那些不大可能抑制PTB-1B 的化合物，使得能够集中力量研究那些比较可能 与PTB-1B结合位点作用的化合物 * * 连智慧 高通量虚拟筛选策略与方法 高通量虚拟筛选应用实例 基于药效基团的数据库搜寻 基于分子对接的虚拟筛选方法 高通量虚拟筛选的一般流程 虚拟筛选在先导化合物发现中的应用 需要区分的三个概念 高通量筛选 虚拟筛选 高通量虚拟筛选 基于小分子的结构—反映与靶标分子互补的关键 结构特征 —间接反映小分子与靶标的作用 基于分子对接进行的虚拟筛选 基于药效团进行的虚拟筛选 基于受体的结构——直接反映 小分子与靶标的结合 高通量虚拟筛选策略与方法 基 于 药