兰州地区HCV_基因变异与干扰素-α应答关系的探讨.pptVIP

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  • 2017-05-19 发布于江西
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兰州地区HCV_基因变异与干扰素-α应答关系的探讨.ppt

兰州地区HCV_基因变异与干扰素-α应答关系的探讨

兰州地区HCV 基因变异与干扰素-α应答关系的探讨 兰州市第二人民医院感染科 李丽 2008年11月 干扰素-α(interferon-α, IFN-α)有抗病毒免疫调节及诱导细胞凋亡等作用,为目前治疗丙型肝炎病毒(hepatitis C virus, HCV ) 感染的主要药物,然而有相当部分患者经IFN-α系统治疗后不能获得持久的病毒转阴。 临床实验证实聚乙二醇化干扰素-α (长效干扰素-α ) 180μg/w,在48周时,病毒阴转率达到60%,而普通干扰素-α的阴转率仅19%,聚乙二醇化干扰素-α联合利巴韦林持续病毒应答率(sustained virological response, SVR)达81%。 研究显示长效干扰素-α也有20%~40%的肝炎患者存在复发和无应答状态,认为这种病例与基因变异和不同基因型的混合感染有关,为证实丙型肝炎病毒(HCV) 5’-NCR基因变异是否与干扰素-α应答有关,我们对40例1b型患者及9例干扰素-α治疗患者进行了HCV 5’-NCR基因变异研究。 已有大量的研究资料证实,5’-NCR变异与基因型相关,1型-6型之间有型特异变异特征和型特异酶切位点。我们采用1-6型通用引物扩增HCV cDNA,即可用于定性检测HCV RNA,又可用于检测基因型和1b型5’-NCR基因变异,探讨5’-NCR变异与干扰素-α治疗免疫应答的关系。 现将40例1b型 5’-NCR变异检测结果和9例干扰素-α治疗患者的5’-NCR变异检测结果汇报如下: 材料和方法 一、材料 1. 40例HCV RNA阳性1b型血清,2005-2006年期间收集,-70℃保存。9例干扰素-α治疗系列血清为2007-2009年期间收集。 2. 限制性内切酶:BsrBI、Hinf I 、HaeⅡ、BstU I、Apo I 、BamH I 、Mbo I 均为Biolabs产品。 3. HCV 5’-NCR PCR扩增引物序列,按照孙南雄报道的序列合成。 材料和方法 一、材料 4. HCV 1b 全基因参考序列,见以下美国NCBI GenBank资料。 AB049088、AF165049、AF165050、AF165051、AF165052、AF165054、AF165059、AF165060、AF165061、AF165062、AF165063、AF165064、 D50480、 D50481、D50482、D50483、D50484、D50485、 D10750、D11168、D90208、M58335、S62220、AF165055、AF165056、AF165057、D85516、AB080299、D14853、AF054247、AF054248、AF054249、AJ132996、AJ132997、AJ238799、AF483269、AF139524,D10934、L02836、AY460204,为中国1b型全基因株。 材料和方法 二、方法 1. 分型方法:采用文献的HCV 5’NCR酶切分型法,对HCV RNA阳性血清分型后,选取HCV 1b型样品检测HCV 5’-NCR变异。 2. BamH Ⅰ和MboⅠ酶切方法,取产物3ul,BamHⅠ或Mbo Ⅰ5个单位,10×buffer 2ul,灭菌水15ul,总体积20ul,37℃酶切2小时。 3. HCV 5’-NCR基因变异株的检测,PAGE或2%琼脂糖胶均可。HCV 5’-NCR基因变异的判断标准:在257bp的PCR产物中,仅有Mbo Ⅰ单切点为野生株,产生2个Mbo Ⅰ切点或无MboⅠ切点及产生BamH Ⅰ切点或部分有切点、部分无切点均判为变异株。 材料和方法 二、方法 4. 干扰素-α治疗剂量:普通干扰素-α即IFNα-2b ,安福隆公司生产,300MU隔日一针,疗程为一年。长效干扰素-α(PEG-IFNα-2a,派罗欣),上海罗氏生产,135、180或270ug,一周一次,疗程为一年。 5. 利巴韦林:所有患者均联合使用利巴韦林(利巴韦林量依据患者体重计算,10-15mg/kg/d),治疗过程中监测血红蛋白及其他不良反应。 6. HCV RNA荧光定量试剂:上海实业科华生物技术有限公司的HCV核酸扩增荧光定量试剂盒,按说明书操作。 结 果 40例HCV 1b基因型患者5’NCR基因变异检测结果: 1 2

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