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第二章 原核生物基因表达调控 转录起始主要由DNA分子上的启动子（promoter)控制;终止由终止子控制. DNA链上提供转录终止信号的序列称为终止子（terminator）。是一个基因的末端或是一个操纵子的末端的一段特定序列。 由启动子到终止子的序列称为转录单位(transcription unit)。 大肠杆菌RNA聚合酶由多亚基组成。α2ββ′ωσ称为全酶（holoenzyme），分子量约为480kDa。σ亚基与全酶结合松弛，应用磷酸纤维素柱很容易使之与全酶分离。解离后的部分（α2ββ′ω）称为核心酶（core enzyme）。 启动子（promoter）是指DNA分子上被RNA聚合酶识别并结合以起始转录的区域。 启动子是控制转录起始的序列，并在很大程度上决定着某一基因的表达强度。 二、原核生物启动子的结构 分析了100多种大肠杆菌启动子的序列，发现主要有2个保守区域：－10区、－35区。 （1）-10区 在转录起始点的上游紧接着一个6bp的保守序列,在几乎目前已知所有的启动子中均存在。其中心位于转录起始点上游约-10bp处（在不同启动子中有所差别），因此这一保守序列又称 为-10序列。其一致序列为T80A95T45A60A50T96，又称为Pribnow框. 其中带下划线的T称为“保守T”。 Pribnow盒是RNA聚合酶的牢固结合位点,又称结合位点,或称为解链区。 该区域富含AT对,熔点较低, RNA聚合酶的结合使得这个AT丰富区消耗较低的能量而解旋，此时RNA聚合酶与启动子的复合物便由封闭复合物(closed-promoter complex) 转变为开放复合物(open-promoter complex) ，转录启动。 （2）－35区 在转录起始点上游－35bp处，有另一个保守序列，称为－35序列。其一致序列为T82T84G78A65C54A45。该保守序列又称Sextama框。RNA聚合酶的σ因子可以识别该位点，所以称作识别位点。RNA聚合酶先识别的这一区域并与之结合，然后再与结合位点相互作用。 决定原核启动子强弱的因素 (1) Sextama Box (-35区） (2) Pribnow Box（-10区） (3) Distance between the two boxes（两个区之间的距离） 三、转录的终止 在大肠杆菌中，有两种类型的终止子，第一类终止子称为不依赖ρ因子的终止子(或称内在终止子intrinsic terminator），在体外实验中足以使转录终止，属强终止子。另一类终止子必须在ρ因子（ρ factor）的存在下才能终止转录，因此称为依赖ρ因子的终止子（ρ-dependent terminator），属弱终止子 。 两类终止子的共同序列特征—— 在转录终止点之前有一段反向重复序列. 5’-ATTAAAGGCTCCTTTTGGAGCCTTTTTTTT-3’ 3’-TAATTTCCGAGGAAAACCTCGGAAAAAAAA-5’ E. coli色氨酸操纵子的转录终止子（不依赖于ρ因子的终止子）及其中的反向重复（黄色） 两类终止子的共同序列特征—— 在转录终止点之前有一段反向重复序列. 5’-ATTAAAGGCTCCTTTTGGAGCCTTTTTTTT-3’ 3’-TAATTTCCGAGGAAAACCTCGGAAAAAAAA-5’ E. coli色氨酸操纵子的转录终止子（不依赖于ρ因子的终止子）及其中的反向重复（黄色） ρ是一个大聚体蛋白质,有两个活性：i.依赖于RNA的NTPase活性，在有单链RNA存在时可水解ATP ；ii.RNA-DNA解旋酶活性：与β亚基作用，使RNA链从复合物中解离。 ρ沿新生RNA链向转录复合物移动，能使RNA聚合酶在ρ依赖性终止子处终止转录。在原核生物中，转录与翻译是同时进行的，ρ因子的终止作用可被核糖体的存在而阻碍。 RNA Pol转录DNA ρ因子附着到RNA