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分子生物学实验课件修改版

实验学时:20 学时 内容安排: 实验一 质粒抽提 实验二 聚合酶链式反应(PCR)扩增DNA片段 实验三 DNA酶切鉴定 实验四 DNA片段回收 实验五 重组质粒的连接 实验六 大肠杆菌感受态细胞的制备及质粒 DNA的转化 实验一 质粒抽提 一、实验目的 学习液体培养大肠杆菌的方法; 掌握从大肠杆菌中提取质粒的原理; 释放出来的DNA遇到强碱性(NaOH)环境,就会变性。然后,用酸性乙酸钾来中和溶液,使溶液处于中性,质粒DNA将迅速复性,而基因组DNA,由于分子巨大,难以复性。 离心后,质粒DNA将在上清中,而基因组DNA则与细胞碎片一起沉淀到离心管的底部。通过这种方法即可将质粒DNA从细菌中提取出来。 三、实验试剂及器材 实验器材:电子天平、锥形瓶、气浴摇床、离心 机 实验试剂:溶液I 、溶液II、溶液III、TE、氯仿、 乙醇 五、注意事项 接种环接种菌落时,一定要冷却彻底,否则容易接种失败; 提取质粒过程中,每一步都尽量多吸取溶液,以得到更高的产率; 用TE溶解沉淀的时候,用移液器小心吹打几次即可。 一般细菌中的基因组DNA含量相当高,为什么利用碱裂解法提取出来的大部分是质粒DNA而不是基因组DNA? 实验二 聚合酶链式反应(PCR)扩增DNA片段 掌握PCR的原理; 学会使用PCR仪; 能利用已知序列设计引物进行一般的PCR实验。 这样,每一双链的DNA模板,经过一次解链、退火、延伸三个步骤的热循环后就成了两条双链DNA分子。 如此反复进行,每一次循环所产生的DNA均能成为下一次循环的模板,每一次循环都使两条人工合成的引物间的DNA特异区拷贝数扩增一倍,PCR产物得以2n的批数形式迅速扩增,经过25~30个循环后,理论上可使基因扩增109倍以上,实际上一般可达106~107倍。 实验器材:PCR仪、移液器 实验试剂:PCR反应液具体见下页 在加PCR反应体系时,由于涉及试剂较多,容易出现漏加、多加现象,须认真操作,多加注意; 加完反应体系后,应在离心机中稍微离心一下,使所加试剂混匀后再放到PCR仪中反应。 如果让你来设计一段已知DNA序列的上下游引物,应该注意哪些方面? 实验三 DNA酶切鉴定 二、实验试剂及器材 实验器材:恒温水浴锅、移液器、离心机 实验试剂:ddH2O、10XBuffer、Plasmid、 EcoRI、HindIII 1. 将清洁干燥并经灭菌的eppendorf管(最好0.5ml)编号,用微量移液枪按照上面体系加入各种试剂; 2. 混匀反应体系后,将eppendorf管置于适当的支持物上(如插在泡沫塑料板上),37℃水浴保温2-3小时,使酶切反应完全。 3. 每管加入2μl 0.1mol/L EDTA(pH8.0),混匀,以停止反应,置于冰箱中保存备用。 使用限制性内切酶时应尽量减少其离开冰箱的时间,以免活性降低活性; 体系总量比较少,属于微量操作,在移取试剂时需要小心,不要用力过猛,导致溶液喷溅。 只要DNA上存在相应的序列,限制性内切酶都可以作用,为什么限制性内切酶没有对自身细胞中的DNA产生损害呢? 实验四 DNA片段回收 一、实验目的 学习DNA纯化的原理和方法; 掌握利用试剂盒从凝胶中回收DNA。 实验器材:恒温水浴锅、移液器、离心机 实验试剂:DNA回收试剂盒 切胶时应快速操作,在紫外灯下时间长容易伤害到眼睛; 称胶前一定要先除去离心管的空重 。 DNA纯化的方法主要有哪些?各有什么优点? 实验五 重组质粒的连接 一、实验目的 掌握DNA连接的原理; 学会用基本的酶切连接的方法。 实验器材:恒温水浴锅、移液器、离心机 实验试剂:DNA连接试剂盒 1、取新的经灭菌处理的0.5ml eppendorf管, 编号。 2、将0.1μg载体DNA转移到无菌离心管中,加等 摩尔量(可稍多)的外源DNA片段。 3、加蒸馏水至体积为8μl,于45℃保温5分钟,以使 重新退火的粘端解链。将混和物冷却至0℃。   4、加入10×T4 DNA ligase buffer 1μl, T4 DNA ligase 0.5μl, 混匀后用微量离心机将 液体全部甩到管底,于16℃保温8-24小时。 5、同时做二组对照反应,其中对照组一只有质粒 载体无外源DNA;对照组二只有外源DNA片段没 有质粒载体。 体系总量比较少,属于微量操作,在移取试剂时需要小心,不要用力过猛,导致溶液喷溅; 一般连接4

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