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第一章蛋白质结构与功能无综述
绪论(Preface) 生物化学期末成绩计算方法 实验要求: 1、每个班级在实验课开课以前按照老师的要求进行分组,分组以后每位同学要严格按照自己被分配的实验室和小组进行实验,在没有征得老师同意得情况下,不得自行调换实验室。 2、实验周(第6周开始)及地点 第一篇 生物大分子的结构与功能 蛋白质的结构与功能 蛋白质的分子组成 蛋白质的分子结构 蛋白质结构与功能的关系 蛋白质的理化性质 蛋白质的分离、纯化与结构分析 一、什么是蛋白质? 蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。 蛋白质研究的历史 二、蛋白质的生物学重要性 1. 蛋白质是生物体重要组成成分 分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。 含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的45%,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达80%。 蛋 白 质 的 分 子 组 成The Molecular Component of Protein ? 组成蛋白质的元素 主要有C、H、O、N和S。 有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有碘 。 ? 蛋白质元素组成的特点 由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量: 一、氨基酸 —— 组成蛋白质的基本单位 存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,且均属 L-α-氨基酸(Gly、Pro除外)。 氨基酸等电点(pI)的计算 pI=1/2(pkn+pK n+1) pI等于兼性离子两边的pk值的平均值 pI计算举例: Asp pK1=1.58, pK2=3.56,pK3=9.6 其pI =1/2(pK1 + pK2) =1/2(1.58+3.56) =2.97 Lys pK1=2.18, pK2=8.95,pK3=10.53 其pI =1/2(pK2 + pK3) =1/2(8.95+10.53) =9.74 二、蛋白质是由许多氨基酸残基组成的多肽链 (二) 几种生物活性肽 1. 谷胱甘肽(glutathione, GSH) 蛋 白 质 的 分 子 结 构The Molecular Structure of Protein 维持蛋白质高级的化学键 1. 氢键 氢键(hydrogen bond)的形成常见于连接在一电负性很强的原子上的氢原子,与另一电负性很强的原子之间。 2. 疏水键 非极性物质(非极性氨基酸残基侧链)在含水的极性环境中存在时,会产生一种相互聚集的力,这种力称为疏水键或疏水作用力。 3. 离子键(盐键) 离子键(salt bond)是由带正电荷基团与带负电荷基团之间相互吸引而形成的化学键。 4.范德华氏(van der Waals)引力 原子、分子、基团之间存在的一种弱的相互作用力。 5.配位键 6.二硫键 结构特点: 右手螺旋 每螺旋圈包含3.6个氨基酸残基,每个残基跨 距0.15nm,螺旋上升一圈0.54nm。 相邻螺旋之间通过肽键上的酰基氧与亚氨基氢 间形成氢键保持螺旋结构稳定。氢键方向与螺 旋长轴基本平行。 氨基酸侧链伸向螺旋外侧,对?-螺旋的形成有一定影响。 举例:角蛋白 肽键平面折叠成锯齿状(折纸状)R-基团交错位于齿状结构上下方 氢键维持稳定与主链长轴垂直 两条以上肽链并列时, ?-片层有 三级结构特点: 单肽链蛋白质构成的最高级结构,包括主链和侧链构象,所有原子呈区域化分布,从伸展程度上讲紧密性更强 三级结构已经形成功能区 五、蛋白质的分类 (二)一级结构不同,功能不同 (二)血红蛋白的构象变化与结合氧 Hb与Mb一样能可逆地与O2结合, Hb与O2结合后称为氧合Hb。氧合Hb占总Hb的百分数(称百分饱和度)随O2浓度变化而改变。 变构效应(allosteric effect) 蛋白质空间结构的改变伴随其功能的变化,称为变构效应。 * 协同效应(cooperativity) 一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象,称为协同效应。 如果是促进作用则称为正协同效应 (positive cooperativity) 如果是抑制作用则称为负协同效应 (negative cooperativity) 变性蛋白的特征 理
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