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第9章蛋白质生物合成完成稿
第九章 蛋白质的生物合成 Protein Biosynthesis,Translation 翻译是蛋白质生物合成的同义词 翻译(translation)是指以mRNA为“模板”、以各种氨基酸为原料合成蛋白质的过程。 第一节 蛋白质生物合成体系 参与蛋白质生物合成的物质包括: 20种氨基酸(AA)作为原料 酶及众多蛋白因子,如IF、eIF ATP、GTP、无机离子 一、翻译模板mRNA及遗传密码 * mRNA是遗传信息的携带者 mRNA上由三个碱基决定一个氨基酸类型的 “单词”形式 ,称三联体密码子或密码子。 研究方法 从mRNA 5?端起始密码子AUG到3?端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框架(open reading frame, ORF)。 1、通用性(Universal) 从病毒直到人类,细胞核DNA指导的蛋白质合成都使用同一套遗传密码。 2、连续性(Continuity ) 移码突变(框移突变) 遗传密码无标点符号: 阅读框架(reading frames): 通常从一个正确起点(AUG)开始,3个一组,一个不漏的读下去至终止密码。若删/增,即引起突变(移码突变)。 无标点符号、读码不重叠 4、简并性(Degeneracy) 遗传密码中,除色氨酸和甲硫氨酸仅有一个密码子外,其余氨基酸有2、3、4个或多至6个三联体为其编码。这称为遗传密码的简并性。 编码同一氨基酸的几组简并密码子上第一二位 碱基多相同,而第三位碱基改变往往不影响氨基酸翻译。 大多数情况下,1个aa可有几种不同的密码子编码即简并性。 同义密码子:编码同一aa的密码子。 如:UUA、UUG、CUU、CUC、CUA、 CUG都编码Leu。 意义:①DNA碱基有较大变化时,仍保持多肽 链中aa顺序不变。 ②减少有害突变,保证了物种的稳定性。 5、摆动性(Wobble) 密码子与反密码子配对,有时会出现不遵从碱基配对规律的情况,称为遗传密码的摆动现象。 密码子、反密码子配对的摆动现象 摆动性: 密码子的专一性主要由前2个碱基决定。 第三位碱基的改变不重要: 如:His:CAU、CAC;第3位均为嘧啶; Glu:CAA、CAG;第3位均为嘌呤。 意义:降低了由于第3个碱基发生突变造成 的误差。 6、起始与终止: 终止密码:UAA、UAG、UGA, 3个不编码aa的,为终止密码,不能被tRNA阅读,只被肽链释放因子识别。 起始密码:AUG, 编码甲硫氨酸(原核为甲酰甲硫氨酸),为起始密码。 少数原核生物是GUG(缬氨酸) 二、核糖体是蛋白质合成的场所 (1)P位:即肽位(peptidyl site),或给位,在延长成肽之后,3′端连接肽链的肽酰tRNA占据的位置,肽链转位至此,延长继续。 (2)A位:即氨基酰位(aminoacyl site),或称受位,每次延长,氨基酰tRNA就加入到A位上,延长成肽中,此位因接受肽酰基链,故名受位。 (3)识别并结合mRNA的部位; 第二节 蛋白质的合成工厂——核糖体 核蛋白体的组成 蛋白质生物合成的分子机制 mRNA解读方向: 5’ →3’ 肽链延伸方向: 从N端向C端进行。 三、tRNA与氨基酸的活化 tRNA的三级结构示意图 (一)氨基酰-tRNA合成酶 tRNA分子的反密码环与mRNA上的密码配对。 tRNA的3’-末端-CCA-OH是氨基酸的结合位点。 由密码 — 反密码 - 氨基酸之间的“对号入座”,保证了从核酸到蛋白质信息传递的准确性。 tRNA与酶结合的模型 反应过程: 分两步,在细胞质中完成: 1)aa-AMP-E 复合物形成:需Mg2+、Mn2+ ; 2)aa从aa-AMP-E 转移到相应的tRNA上: 氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。 氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreading activity) 。 氨基酰-tRNA的表示方法: Ala-tRNAAla Ser-tRNASer Met-tRNAMet 过程 ①肽链合成的起始; ②肽链的延长; ③肽链的终止。 一、原核生物翻译起
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