槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释.PDF

福建农林大学学报(自然科学版) 第４５卷 第２期 Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｆｕｊｉａｎ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ ａｎｄ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ (Ｎａｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｅｄｉｔｉｏｎ) ２０１６年３月 槐猪和杜洛克猪背最长肌差异 表达基因的筛选与注释 １ １ １ １ １ ２ １ 杨建敏 ꎬ胡宇平 ꎬ林威敏 ꎬ张金耀 ꎬ黄守婷 ꎬ叶鼎承 ꎬ 肖天放 (１.福建农林大学动物科学学院ꎬ福建福州３５０００２ꎻ２.福建省 农业科学院畜牧兽医研究所ꎬ福建福州３５０００３) 摘要:为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因ꎬ对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序ꎬ并进行生物信 息学分析.结果表明ꎬ槐猪和杜洛克猪分别获得３６ １７７ ８４４ 和３４ ４９６ ４５０条可用读段ꎬ且与猪参考基因组的比对率分别为 ７８.７１％和８０.０９％.槐猪和杜洛克猪间共有９５３个差异表达基因ꎬ以杜洛克猪为对照组ꎬ槐猪与之相比ꎬ有５８９个上调基因和 ３６４个下调基因.槐猪和杜洛克猪的差异表达基因共分类到４８个基因本体(ＧＯ)条目中ꎬ其中ꎬ细胞组分 １３个、分子功能 １２ 个和生物学过程２３个.显著富集的ＫＥＧＧ通路共计６个ꎬ其中ꎬＰＰＡＲ信号通路是与调节脂类代谢显著相关的通路. 关键词:槐猪ꎻ杜洛克猪ꎻ背最长肌ꎻ差异表达ꎻ转录组测序 中图分类号:Ｓ８２８ꎻＳ８１３.３ 文献标识码:Ａ 文章编号:１６７１￣５４７０(２０１６)０２￣０１９２￣０４ ＤＯＩ:１０.１３３２３/ ｊ.ｃｎｋｉ.ｊ.ｆａｆｕ(ｎａｔ.ｓｃｉ.).２０１６.０２.０１２ Ｓｃｒｅｅｎ ａｎｄ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｏｆ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ｇｅｎｅｓ ｉｎ ｌｏｎｇｉｓｓｉｍｕｓ ｄｏｒｓｉ ｍｕｓｃｌｅ ｏｆ Ｈｕａｉ ｐｉｇ ａｎｄ Ｄｕｒｏｃ ｐｉｇ １ １ １ １ ＹＡＮＧＪｉａｎｍｉｎ ꎬＨＵ Ｙｕｐｉｎｇ ꎬＬＩＮ Ｗｅｉｍｉｎ ꎬＺＨＡＮＧＪｉｎｙａｏ ꎬ １ ２ １ ＨＵＡＮＧ Ｓｈｏｕｔｉｎｇ ꎬＹＥ Ｄｉｎｇｃｈｅｎｇ ꎬＸＩＡＯＴｉａｎｆａｎｇ (１.Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ａｎｉｍａｌ ＳｃｉｅｎｃｅꎬＦｕｊｉａｎ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ ａｎｄ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＦｕｚｈｏｕꎬＦｕｊｉａｎ ３５０００２ꎬＣｈｉｎａꎻ２.Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｈｕｓｂａｎｄｒｙ ａｎｄ Ｖｅｔｅｒｉｎａｒｙ ＭｅｄｉｃｉｎｅꎬＦｕｊｉａｎ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ ＳｃｉｅｎｃｅｓꎬＦｕｚｈｏｕꎬＦｕｊｉａｎ ３５０００３ꎬＣｈｉｎａ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｉｎ ｏｒｄｅｒｔｏｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｔｈｅｆｕｎｃｔｉｏｎｏｆ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄｇｅｎｅｓａｎｄｇｅｎｅｐｒｏｄｕｃｔ ｏｎｍｅｔａｂｏｌｉｓｍꎬｄｉｇｉｔａｌ ｇｅｎｅｅｘｐｒｅｓ￣ ｓｉｏｎｐｒｏｆｉｌｅｓｉｎｌｏｎｇｉｓｓｉｍｕｓｄｏｒｓｉｍｕｓｃｌｅｏｆ Ｈｕａｉｐｉｇ (ｆａｔ)ａｎｄＤｕｒｏｃｐｉｇ (ｌｅａｎ)ｗｅｒｅｂｕｉｌｔｕｓｉｎｇＲＮＡ￣ｓｅｑｍｅｔｈｏｄꎬａｎｄｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌ￣ ｌｙ ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ ｇｅｎｅｓｗｅｒｅ ｓｃｒｅｅ