蛋白质组学在生殖医学中的应用.pdfVIP

中国优生与遗传杂志 2006年第 14 卷第 12期 ·1 · 蛋白质组学在生殖医学中的应用 1 2 1 钱沁佳 , 李彩霞 , 曹立萍 ( 1. 解放军第 425 医院妇产科 , 海南三亚 　572012　2. 第三军医大学西南医院 , 重庆 ) 中图分类号 : R34 1　　　文献标识码 : A 　　　文章编号 : 1006 - 9534 (2006) 12 - 000 1 - 03 　　蛋白质组学是在人类基因组计划研究发展的基础上形成 链接和整合 。主要的蛋白质组数据库有蛋白质氨基酸序列 的新兴学科 ,蛋白质组主要是指一个基因组、一种生物或一种 数据库如 SW ISS - PRO T、P IR 和 TrEMBL 等 。蛋白质结构数 细胞 /组织所表达的全套蛋白质 ,它主要研究蛋白质的特性 , 据库如 PDB、SW ISS - MOD EL 和 NRL - 3D 等 ;蛋白质 2 - D E 包括蛋白质表达水平 、氨基酸序列、翻译后加工和蛋白质的相 图谱数据库如 SW ISS - 2D PA GE等 。此外国际上已有不同 互作用 ,在蛋白质水平上了解细胞的各种功能、生理生化及疾 组织 、体液 、微生物或细胞株的蛋白质组数据库 。这些数据 病的病理过程等 [ 1 ] 。蛋白质组学集中于动态描述基因调节 , 库产生一个功能强大的知识资源 ,对解译来 自众多物种的功 对基因表达的蛋白质水平进行定量测定 ,鉴定疾病 、药效对生 能基因组和蛋白质组的结果非常有用 。 命过程的影响 , 以及解释基因表达调控的机制 [2 ] 。 另外 ,蛋白质组学必须有软件工具来进行质谱数据和序 传统的蛋白质研究注重研究单一蛋白质 ,而蛋白质组学 列数据库的关联 ,现存的数据库搜索程序已经变得越来越成 注重研究参与特定生理或病理状态的所有蛋白质种类及其 熟 ,主 要 相 关 程 序 有 Sequest , MA SCOT, Pep tede Search, ( ) 与周围环境 分子 的关系 。与基因组研究相比 , 由于基因的 PROWL 和 Protein Pro sp ector等 。其它如蛋白质双向电泳图谱 拼接和翻译后的修饰 ,蛋白质的数 目远大于基因的数 目;而 分析软件 M elan ie3和蛋白质结构分析和功能预测软件等等 。 且基因是相对静态的 ,蛋白质是动态的 ,随时间、空间的变化 二 、蛋白质组学技术在生殖生理学研究中的作用 而变化 。随着研究的发展 ,形成了蛋白质组研究的三大基本 生物体胚胎发生的每个阶段 、每个时期的活动是受到严 支撑技术 :双向电泳技术 、计算机图像分析与大规模数据处 格调控的 ,其中任何一个环节失控 ,都会导致不孕或妊娠失 理技术以及质谱技术 。基本技术路线是得到蛋白质表达谱 败的发生 。月经周期中子宫内膜 、卵母细胞以及精子在不同 后采用计算机图像分析 ,实现对蛋白质的鉴定 。 的时期 ,在蛋白质水平方面会有所变化 。对这些蛋白质变化 一 、蛋白质的核心技术 的研究有助于我们更好的了解生殖生理学的奥秘 。因而建